84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1337 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1337  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0264251  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1595  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  60 
 
 		 234 aa  286  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.377803  decreased coverage  0.000639268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0379  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  44.3 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5069  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.17 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0446  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.6 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5019  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.17 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4893  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.17 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.37927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0515  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66990  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.17 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3763  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.82 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.389406  normal  0.99117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5810  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.6 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3423  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.03 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0381  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.6 
 
 		 235 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.450102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5158  hypothetical protein  41.03 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1548  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.14 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.030383  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0907  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  41.18 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2222  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.17 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1729  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.2392  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0867  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.17 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2956  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.44 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45490  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.82 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3192  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.71 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3091  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.71 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1850  protein of unknown function DUF558  32.62 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.693954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2992  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.16 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0758461  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45316  predicted protein  33.95 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0840012  normal  0.295548 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2720  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.88 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32846  predicted protein  26.88 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0090  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.44 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0063  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  20.97 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0682  hypothetical protein  25.96 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.356679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1212  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.7 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1169  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.03 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4594  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.48 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.246782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1997  protein of unknown function DUF558  29.07 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0340  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.67 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3241  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.5 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0197  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.57 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000890176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2283  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.14 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4176  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.34 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1795  protein of unknown function DUF558  23.38 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1997  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.94 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.650979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0224  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.98 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0361  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.18 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0176387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3334  hypothetical protein  24.36 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1587  hypothetical protein  24.77 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1998  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.36 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2161  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.02 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1645  protein of unknown function DUF558  25.97 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1562  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.53 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.297066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1925  protein of unknown function DUF558  27.39 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0289082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2054  hypothetical protein  25.61 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1088  protein of unknown function DUF558  20.54 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4104  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.85 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12770  conserved hypothetical protein TIGR00046  22.54 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000425435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3545  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.02 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1732  hypothetical protein  27.93 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.127797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1295  protein of unknown function DUF558  25.78 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1323  protein of unknown function DUF558  25.78 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03291  hypothetical protein  22.52 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1402  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.82 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2156  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.67 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2076  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.39 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0587  hypothetical protein  25.61 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.256095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1319  hypothetical protein  22.12 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4134  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.64 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0859841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2303  hypothetical protein  23.29 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4065  protein of unknown function DUF558  23.53 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3975  protein of unknown function DUF558  22.95 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7237  protein of unknown function DUF558  29.1 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1575  hypothetical protein  22.84 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0110049  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1841  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.35 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11710  conserved hypothetical protein TIGR00046  25.11 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.444183  normal  0.98437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0201  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.19 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0610  protein of unknown function DUF558  24.59 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2244  hypothetical protein  51.06 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00252887  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1993  protein of unknown function DUF558  25.96 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.049099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3224  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000433897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0449  protein of unknown function DUF558  22.12 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1175  protein of unknown function DUF558  26.45 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3972  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.23 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0215  hypothetical protein  26.41 
 
 		 254 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.274516 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0226  hypothetical protein  26.41 
 
 		 253 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0519  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.75 
 
 		 240 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>