82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1595 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1595  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.377803  decreased coverage  0.000639268 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1337  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  60 
 
 		 242 aa  286  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0264251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0379  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.35 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66990  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.22 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5810  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.64 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5069  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  41.95 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4893  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  42.37 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.37927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0515  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.59 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0446  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.22 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5019  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  41.53 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3423  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.63 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0907  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  45.99 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0381  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  41.95 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.450102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1729  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.37 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.2392  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1548  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  39.37 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.030383  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2222  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.47 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5158  hypothetical protein  40.68 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3763  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.6 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.389406  normal  0.99117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45490  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.35 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2956  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.72 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3192  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3091  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.72 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0867  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.05 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2992  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.37 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0758461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1850  protein of unknown function DUF558  33.19 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.693954 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45316  predicted protein  34.56 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0840012  normal  0.295548 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2720  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.76 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1925  protein of unknown function DUF558  33.18 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0289082  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32846  predicted protein  26.95 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0063  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.75 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4594  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.3 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.246782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1997  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.61 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.650979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1732  hypothetical protein  26.79 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.127797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4065  protein of unknown function DUF558  22.33 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0682  hypothetical protein  26.94 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.356679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2283  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.24 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3218  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.93 
 
 		 257 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000318733  hitchhiker  0.0000151601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1562  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.62 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.297066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1169  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.26 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2054  hypothetical protein  29.11 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1998  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.85 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11710  conserved hypothetical protein TIGR00046  29.24 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.444183  normal  0.98437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1587  hypothetical protein  27.23 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2076  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.73 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1212  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  47.92 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4176  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.84 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1402  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.66 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1192  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.11 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0525282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5042  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.97 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319742  normal  0.272315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2303  hypothetical protein  21.89 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3545  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  21.58 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3334  hypothetical protein  23.68 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1186  protein of unknown function DUF558  24.78 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0115216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1997  protein of unknown function DUF558  27.4 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12350  conserved hypothetical protein TIGR00046  28.51 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0978369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1285  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.86 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0661  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.57 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_6230  predicted protein  27.48 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1573  protein of unknown function DUF558  27.11 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.475919  normal  0.0145737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0765  hypothetical protein  23.48 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.417208  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1597  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.69 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269441  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0995  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.52 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4766  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  48.28 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1352  protein of unknown function DUF558  23.56 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.13252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3251  protein of unknown function DUF558  29.63 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.131486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0340  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.19 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4444  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.31 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000243025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0224  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.5 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0449  protein of unknown function DUF558  24.77 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01646  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.82 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0018  hypothetical protein  25.73 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0966  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.58 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.373611  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4048  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.31 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.702448  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0226  hypothetical protein  25.21 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4536  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.31 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4058  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.83 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0577638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4210  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.31 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0876638  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0361  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  18.52 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0176387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4333  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.31 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.98604e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4392  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.31 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0158003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1319  hypothetical protein  24.02 
 
 		 247 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0806  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.83 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000483246  decreased coverage  9.34554e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>