38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_45316 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_45316  predicted protein  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0840012  normal  0.295548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4893  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.74 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.37927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0379  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.17 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5019  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.74 
 
 		 235 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0446  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.74 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5069  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.17 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1850  protein of unknown function DUF558  34.71 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.693954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66990  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.04 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5810  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.04 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0515  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.63 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1595  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.56 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.377803  decreased coverage  0.000639268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3192  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.6 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2956  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.06 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32846  predicted protein  29.82 
 
 		 333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1337  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.95 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0264251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3091  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.6 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0381  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.75 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.450102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5158  hypothetical protein  33.9 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2222  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.51 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0907  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.33 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3423  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.23 
 
 		 239 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0867  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.57 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680151 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1548  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.86 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.030383  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2992  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.24 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0758461  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2720  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.27 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3763  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.84 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.389406  normal  0.99117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1729  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.98 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.2392  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45490  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.91 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0682  hypothetical protein  28.21 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.356679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0063  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  22.94 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3241  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.49 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4176  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.5 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0765  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.417208  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0173  protein of unknown function DUF558  24.07 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0143  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  46.15 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1500  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  45.24 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0500353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1646  protein of unknown function DUF558  25.81 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  hitchhiker  0.00800846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1175  protein of unknown function DUF558  24.78 
 
 		 241 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>