More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1769 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  90.98 
 
 		 403 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 403 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  54.39 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  51.13 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  51.49 
 
 		 400 aa  345  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  49.37 
 
 		 400 aa  322  9.000000000000001e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  45.83 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  50.27 
 
 		 414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  46.12 
 
 		 415 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  46.75 
 
 		 399 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  45 
 
 		 399 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  42.11 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  37.86 
 
 		 457 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  39.14 
 
 		 419 aa  282  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  39.85 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  42.3 
 
 		 410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  37.59 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  37.32 
 
 		 411 aa  262  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  39.7 
 
 		 418 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  35.19 
 
 		 451 aa  258  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  40.25 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  40.25 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  40.25 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  41.25 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  39.25 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  39 
 
 		 398 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  33.99 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  40.05 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  42.86 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  35.92 
 
 		 387 aa  236  8e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  41.34 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  39.95 
 
 		 397 aa  225  9e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  38.67 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  32.67 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  37.69 
 
 		 398 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  38.5 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  35.8 
 
 		 407 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  31.43 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  30.73 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.38 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  31.16 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 660 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  33.25 
 
 		 685 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  35.57 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  33.01 
 
 		 660 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  33.01 
 
 		 660 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  33.01 
 
 		 660 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  33.01 
 
 		 671 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  32.46 
 
 		 682 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  35.57 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  33.01 
 
 		 660 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.19 
 
 		 443 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  30.73 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  32.54 
 
 		 604 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  32.54 
 
 		 604 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  32.78 
 
 		 688 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  30.66 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.22 
 
 		 650 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  31.05 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.06 
 
 		 608 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.96 
 
 		 672 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.4 
 
 		 408 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.74 
 
 		 674 aa  156  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.43 
 
 		 678 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.98 
 
 		 664 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.98 
 
 		 673 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.98 
 
 		 666 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  31.74 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.91 
 
 		 941 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 413 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.22 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.62 
 
 		 679 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  29.9 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.52 
 
 		 605 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.88 
 
 		 630 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  32.94 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  32.93 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  27.58 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.27 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  31.71 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.64 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.86 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.58 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.19 
 
 		 560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.31 
 
 		 644 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.98 
 
 		 662 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.49 
 
 		 641 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  31.46 
 
 		 401 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0814  aminotransferase, class V  32.33 
 
 		 437 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.76 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.45 
 
 		 610 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  31.86 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.43 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.46 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.02 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  30.05 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.61 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>