More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02028 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  851    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  46.94 
 
 
411 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  47.38 
 
 
416 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  45.52 
 
 
409 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  45.19 
 
 
387 aa  349  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  41.15 
 
 
414 aa  335  9e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  39.76 
 
 
419 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  39.69 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  41.69 
 
 
410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  42.46 
 
 
415 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  39.71 
 
 
418 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  40.36 
 
 
451 aa  316  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  40.05 
 
 
410 aa  302  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  39.45 
 
 
421 aa  286  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  36.16 
 
 
395 aa  258  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  35.24 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  33.99 
 
 
403 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  34.24 
 
 
403 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  36 
 
 
414 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  35.43 
 
 
398 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  32.84 
 
 
399 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  33.08 
 
 
400 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  35.32 
 
 
407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  32.26 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  31.57 
 
 
425 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  33.5 
 
 
397 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.17 
 
 
429 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.17 
 
 
429 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.3 
 
 
406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.22 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  32.46 
 
 
412 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.26 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  29.27 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  29.3 
 
 
412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.43 
 
 
407 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.5 
 
 
406 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.43 
 
 
407 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.74 
 
 
406 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.58 
 
 
408 aa  171  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.98 
 
 
419 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 
418 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.48 
 
 
409 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.74 
 
 
419 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  28.61 
 
 
404 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  27.76 
 
 
399 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  29.82 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.79 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.79 
 
 
406 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.47 
 
 
425 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.81 
 
 
412 aa  167  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.79 
 
 
406 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.3 
 
 
406 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  29.79 
 
 
420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  29.76 
 
 
417 aa  166  9e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.5 
 
 
415 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.54 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29 
 
 
418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.55 
 
 
406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.55 
 
 
406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.14 
 
 
420 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.02 
 
 
417 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.87 
 
 
414 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.98 
 
 
407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  28.47 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.09 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  28.16 
 
 
419 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  27.59 
 
 
421 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  28.02 
 
 
406 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  28.02 
 
 
406 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.02 
 
 
406 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.09 
 
 
604 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  28.3 
 
 
682 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.02 
 
 
406 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.02 
 
 
406 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.78 
 
 
420 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  28.78 
 
 
412 aa  162  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.17 
 
 
608 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.02 
 
 
406 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.09 
 
 
604 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.91 
 
 
413 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.02 
 
 
406 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.05 
 
 
404 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.95 
 
 
410 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  27.62 
 
 
688 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.4 
 
 
644 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.47 
 
 
408 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.43 
 
 
415 aa  159  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.64 
 
 
414 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.43 
 
 
429 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  28.74 
 
 
411 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.86 
 
 
650 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.14 
 
 
679 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.14 
 
 
630 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  27.74 
 
 
442 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.4 
 
 
406 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.59 
 
 
414 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.78 
 
 
406 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  30.02 
 
 
420 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.37 
 
 
416 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>