More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1261 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  100 
 
 		 397 aa  782    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  48.85 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  37.25 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  36.14 
 
 		 419 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  34.75 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  37.34 
 
 		 415 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  39.2 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  39.95 
 
 		 403 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  32.74 
 
 		 451 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  34.96 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  35.24 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  35.29 
 
 		 416 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  36.08 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  41.21 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  36.25 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  33.5 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  34.25 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  32.77 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  38 
 
 		 400 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  33.5 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  33.66 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  33.08 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  35.45 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  32.77 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  36.39 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  36.59 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  38.08 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  34.08 
 
 		 395 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  36.48 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  34.58 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  35 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  30.1 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0814  aminotransferase, class V  31.63 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  33.33 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.08 
 
 		 885 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  33.09 
 
 		 412 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  28 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.24 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.95 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.34 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.88 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.88 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.3 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  31.96 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.9 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.77 
 
 		 674 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.77 
 
 		 672 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.88 
 
 		 406 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.88 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  31.58 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.76 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.29 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.64 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.64 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.64 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.64 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.21 
 
 		 433 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  27.64 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  27.64 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  27.64 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.53 
 
 		 430 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  30.53 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  28.4 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.95 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.5 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.64 
 
 		 673 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  30.09 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2851  aminotransferase, class V  34.47 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.35 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  31.3 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  31.4 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.45 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.47 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.25 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.86 
 
 		 407 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  32.6 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.15 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  28.47 
 
 		 422 aa  139  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.11 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.01 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.29 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  29.27 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.62 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.36 
 
 		 879 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  30.88 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  31.08 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.29 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.88 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  30.88 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  30.49 
 
 		 878 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.62 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.01 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.33 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  29.41 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.97 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.71 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.54 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>