More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0949 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
412 aa  838    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.14 
 
 
415 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.14 
 
 
409 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.94 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  47.46 
 
 
406 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  47.46 
 
 
406 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  47.7 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  47.46 
 
 
406 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.7 
 
 
406 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  47.7 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  47.7 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  47.7 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.17 
 
 
406 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.77 
 
 
408 aa  396  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  47.7 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  47.46 
 
 
406 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.52 
 
 
406 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  47.45 
 
 
413 aa  378  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  52.28 
 
 
408 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.77 
 
 
418 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  48.04 
 
 
414 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  43.96 
 
 
410 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  47.29 
 
 
420 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.63 
 
 
410 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.58 
 
 
418 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.26 
 
 
413 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.26 
 
 
413 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.18 
 
 
414 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.93 
 
 
414 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  45.97 
 
 
416 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.97 
 
 
416 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.92 
 
 
608 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.78 
 
 
404 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  44.55 
 
 
410 aa  363  4e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.06 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  44.94 
 
 
405 aa  362  9e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  47.92 
 
 
682 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  48.28 
 
 
661 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  47.2 
 
 
414 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.28 
 
 
435 aa  359  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.42 
 
 
650 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.93 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.18 
 
 
666 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.95 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  48.06 
 
 
666 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.88 
 
 
417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.57 
 
 
414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.79 
 
 
630 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.52 
 
 
412 aa  356  5e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.1 
 
 
451 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  47.06 
 
 
688 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.85 
 
 
414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  45.35 
 
 
424 aa  352  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.26 
 
 
678 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  48.16 
 
 
429 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.55 
 
 
679 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.43 
 
 
412 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  44.53 
 
 
404 aa  351  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  45.99 
 
 
395 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.43 
 
 
420 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.02 
 
 
411 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.22 
 
 
419 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.85 
 
 
414 aa  350  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 
441 aa  348  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.9 
 
 
644 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.02 
 
 
404 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.52 
 
 
443 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.55 
 
 
408 aa  346  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.78 
 
 
425 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.86 
 
 
406 aa  346  5e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.7 
 
 
419 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  44.15 
 
 
419 aa  345  8e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.99 
 
 
418 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.86 
 
 
419 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.96 
 
 
412 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.74 
 
 
415 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.83 
 
 
641 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.26 
 
 
414 aa  344  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.45 
 
 
404 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.74 
 
 
560 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.93 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  44.47 
 
 
423 aa  342  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  44.85 
 
 
626 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.24 
 
 
415 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.88 
 
 
441 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  44.74 
 
 
421 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.88 
 
 
605 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.08 
 
 
417 aa  340  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  47.13 
 
 
417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.88 
 
 
442 aa  340  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  40.99 
 
 
412 aa  339  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.93 
 
 
941 aa  339  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.28 
 
 
407 aa  339  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.66 
 
 
408 aa  339  5e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.2 
 
 
414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.2 
 
 
414 aa  339  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.12 
 
 
413 aa  338  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.88 
 
 
414 aa  338  9e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  44.88 
 
 
405 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  42.96 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>