More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13380 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  100 
 
 
441 aa  882    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.62 
 
 
421 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.08 
 
 
433 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.5 
 
 
435 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  61.36 
 
 
429 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.01 
 
 
425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.6 
 
 
421 aa  518  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.45 
 
 
419 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  61.23 
 
 
424 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.05 
 
 
443 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.64 
 
 
442 aa  514  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.36 
 
 
426 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.48 
 
 
435 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.79 
 
 
449 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.26 
 
 
417 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  56.42 
 
 
421 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.74 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.26 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  58.81 
 
 
417 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.26 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.83 
 
 
415 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.77 
 
 
419 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.66 
 
 
442 aa  481  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.02 
 
 
432 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  56.85 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.79 
 
 
446 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  59.86 
 
 
435 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  52.57 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.77 
 
 
418 aa  441  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.93 
 
 
434 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.69 
 
 
434 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.85 
 
 
411 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.26 
 
 
441 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.4 
 
 
443 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.27 
 
 
414 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.05 
 
 
428 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.58 
 
 
414 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.6 
 
 
406 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.83 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.15 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.16 
 
 
412 aa  408  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  50.59 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.54 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  47.38 
 
 
452 aa  398  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.88 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  43.99 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  44.68 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  44.68 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  44.68 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.78 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  44.65 
 
 
420 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  45.14 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  45.14 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  45.14 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.65 
 
 
420 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  44.91 
 
 
406 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  44.68 
 
 
406 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  44.91 
 
 
406 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.55 
 
 
420 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.41 
 
 
429 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.18 
 
 
429 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.18 
 
 
429 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.6 
 
 
419 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.37 
 
 
419 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  43.76 
 
 
423 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.92 
 
 
413 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  44.65 
 
 
419 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.92 
 
 
413 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.4 
 
 
414 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.79 
 
 
414 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.33 
 
 
416 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.94 
 
 
451 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.27 
 
 
417 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.16 
 
 
414 aa  379  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  42.72 
 
 
413 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  46.53 
 
 
424 aa  378  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.18 
 
 
406 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.79 
 
 
406 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  44.19 
 
 
417 aa  375  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.29 
 
 
410 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.45 
 
 
415 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.78 
 
 
414 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.63 
 
 
429 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.2 
 
 
414 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.2 
 
 
414 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.99 
 
 
407 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  44.6 
 
 
434 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.6 
 
 
406 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.52 
 
 
407 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  43.46 
 
 
414 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  46.34 
 
 
422 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.19 
 
 
406 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.7 
 
 
425 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.79 
 
 
412 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.69 
 
 
407 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.28 
 
 
404 aa  364  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  42.99 
 
 
420 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  46.84 
 
 
408 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.44 
 
 
417 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.86 
 
 
406 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>