More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0816 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  99.03 
 
 		 412 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0814  aminotransferase, class V  81.69 
 
 		 437 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  100 
 
 		 412 aa  830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  70.02 
 
 		 409 aa  570  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  52.31 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  52.32 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  44.69 
 
 		 412 aa  268  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  37.14 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  30.68 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  33.67 
 
 		 398 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  32.54 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  30.11 
 
 		 457 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  31.08 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  33.41 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  35.57 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  31.51 
 
 		 415 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  30.59 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  27.65 
 
 		 451 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  36.3 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  27.94 
 
 		 414 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  30.28 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  30.3 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  27.36 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  29.64 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  28.21 
 
 		 387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  31.13 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  32.52 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  32.28 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.1 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.02 
 
 		 406 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.69 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.62 
 
 		 429 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.3 
 
 		 414 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.97 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.52 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.95 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  32.92 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.67 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.13 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.13 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  27.29 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.29 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  27.91 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.71 
 
 		 572 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  30.27 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.28 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.93 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  29.51 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.66 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  28.47 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  30.79 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.36 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.94 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.8 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.7 
 
 		 407 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.59 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  27.53 
 
 		 404 aa  113  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.4 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.1 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  28.1 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.04 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.1 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  28.1 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  27.67 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.04 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.31 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.88 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.64 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  27 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.42 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.93 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.87 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  28.92 
 
 		 688 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.71 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  33.94 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.92 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.73 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.61 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.87 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 		 630 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.9 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.92 
 
 		 650 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.86 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.48 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.67 
 
 		 878 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.38 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.92 
 
 		 666 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.25 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.38 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.38 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 679 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  29.51 
 
 		 604 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  29.51 
 
 		 604 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.6 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.27 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  31.14 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.35 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  28.68 
 
 		 666 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  27.53 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>