More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2089 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  81.94 
 
 
442 aa  725    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
441 aa  891    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.79 
 
 
421 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.93 
 
 
418 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  65.8 
 
 
421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  65.08 
 
 
424 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.78 
 
 
419 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.98 
 
 
434 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  64.37 
 
 
429 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.49 
 
 
433 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.32 
 
 
434 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  63.9 
 
 
429 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.05 
 
 
443 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.32 
 
 
411 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.95 
 
 
435 aa  544  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.36 
 
 
425 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.32 
 
 
428 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.53 
 
 
435 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.24 
 
 
435 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.05 
 
 
449 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.14 
 
 
421 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.06 
 
 
426 aa  481  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  57.74 
 
 
441 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.72 
 
 
419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  56.77 
 
 
417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  57.48 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.29 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.53 
 
 
429 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.11 
 
 
414 aa  461  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.01 
 
 
429 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.82 
 
 
414 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.53 
 
 
429 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.47 
 
 
415 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.74 
 
 
442 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.21 
 
 
412 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  56 
 
 
417 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  56 
 
 
417 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.24 
 
 
417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.91 
 
 
446 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  55.82 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.06 
 
 
425 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.5 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.9 
 
 
417 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  56.24 
 
 
435 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.14 
 
 
420 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.16 
 
 
414 aa  432  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  53.94 
 
 
414 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  49.88 
 
 
423 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.28 
 
 
420 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.48 
 
 
416 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.83 
 
 
414 aa  426  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  49.17 
 
 
420 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.17 
 
 
406 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.07 
 
 
451 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.47 
 
 
443 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.41 
 
 
406 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.07 
 
 
413 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.7 
 
 
441 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  49.41 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.23 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.59 
 
 
419 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  45.5 
 
 
420 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 
418 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  47.39 
 
 
413 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.7 
 
 
429 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  48.22 
 
 
414 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  46.34 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.97 
 
 
413 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  46.34 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  46.34 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.97 
 
 
413 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  46.34 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  46.34 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.39 
 
 
412 aa  408  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  46.34 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  47.48 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
413 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.84 
 
 
406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.14 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  46.1 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  46.34 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  48.44 
 
 
419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.22 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  47.48 
 
 
405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.86 
 
 
406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.14 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.16 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  48.93 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.06 
 
 
408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.34 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  46.1 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  48.54 
 
 
434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.97 
 
 
408 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  47.33 
 
 
428 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  48.32 
 
 
417 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  49.77 
 
 
417 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.65 
 
 
408 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.45 
 
 
409 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.03 
 
 
417 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>