More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1436 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  100 
 
 
411 aa  847    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  64.71 
 
 
442 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  53.69 
 
 
409 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  52.21 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  52.21 
 
 
412 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0814  aminotransferase, class V  47.82 
 
 
437 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  41.05 
 
 
412 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  32.35 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  33.01 
 
 
425 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  30.85 
 
 
457 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  31.82 
 
 
415 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  32.77 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  29.37 
 
 
398 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  30 
 
 
418 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  30.73 
 
 
410 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  28.64 
 
 
451 aa  179  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  30.14 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  27.16 
 
 
414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.17 
 
 
417 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.82 
 
 
408 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  28.44 
 
 
416 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  28.47 
 
 
411 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.34 
 
 
429 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  28.74 
 
 
412 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 
429 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  30.73 
 
 
403 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.71 
 
 
429 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  28.68 
 
 
409 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.94 
 
 
409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.67 
 
 
407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.95 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.43 
 
 
407 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  30.97 
 
 
401 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  27.63 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  30.64 
 
 
403 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.62 
 
 
412 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  27.67 
 
 
414 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.58 
 
 
408 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.6 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.95 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.71 
 
 
406 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  28.27 
 
 
405 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.1 
 
 
414 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.43 
 
 
414 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.95 
 
 
406 aa  136  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.36 
 
 
413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  26.83 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  28.44 
 
 
419 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  30.17 
 
 
413 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.35 
 
 
427 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  30.19 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.12 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  29.09 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 
416 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.54 
 
 
404 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.96 
 
 
416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.33 
 
 
442 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.89 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.37 
 
 
428 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.5 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  28.03 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  26.26 
 
 
387 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  28.26 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.71 
 
 
430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  28.88 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  28.57 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1138  aminotransferase class V  29.19 
 
 
401 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.9 
 
 
406 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.08 
 
 
443 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.22 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  28.67 
 
 
421 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  28.02 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.14 
 
 
416 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.34 
 
 
415 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.9 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.9 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.38 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  29.57 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.02 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.07 
 
 
435 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  29.06 
 
 
413 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  29.08 
 
 
626 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.81 
 
 
418 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  26.65 
 
 
410 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  27.99 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.64 
 
 
610 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.34 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  29.22 
 
 
604 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.14 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.5 
 
 
433 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  29.22 
 
 
604 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.67 
 
 
412 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.47 
 
 
404 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.57 
 
 
419 aa  126  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.9 
 
 
679 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.52 
 
 
641 aa  126  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.6 
 
 
414 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.05 
 
 
425 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  25.88 
 
 
412 aa  125  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.73 
 
 
451 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>