More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1319 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
413 aa  848    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.67 
 
 
408 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.45 
 
 
414 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.89 
 
 
414 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.71 
 
 
413 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.36 
 
 
413 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  54.72 
 
 
414 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  54.24 
 
 
414 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.11 
 
 
413 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.72 
 
 
413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.93 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.93 
 
 
418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.61 
 
 
426 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.48 
 
 
414 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.95 
 
 
413 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.98 
 
 
419 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.03 
 
 
420 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.95 
 
 
413 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  53.27 
 
 
414 aa  454  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  54.15 
 
 
416 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  52.23 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.9 
 
 
415 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.7 
 
 
451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.03 
 
 
414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  53.48 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.74 
 
 
414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.42 
 
 
415 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  53.09 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.99 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.93 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  54.27 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.47 
 
 
421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.94 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.33 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.6 
 
 
409 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.34 
 
 
429 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.58 
 
 
429 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  49.25 
 
 
414 aa  431  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.34 
 
 
429 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.98 
 
 
406 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.91 
 
 
412 aa  428  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
673 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.59 
 
 
414 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.15 
 
 
416 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.26 
 
 
404 aa  425  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.86 
 
 
407 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.63 
 
 
417 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.73 
 
 
406 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.63 
 
 
406 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  51.24 
 
 
406 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
418 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.22 
 
 
418 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.85 
 
 
403 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  51.83 
 
 
421 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.5 
 
 
404 aa  418  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.62 
 
 
404 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
429 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.49 
 
 
413 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.65 
 
 
408 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  48.61 
 
 
404 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  49 
 
 
664 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  49 
 
 
405 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.99 
 
 
674 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.99 
 
 
672 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  49 
 
 
419 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.88 
 
 
406 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
419 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  48.09 
 
 
405 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.49 
 
 
662 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  49.38 
 
 
406 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  48.37 
 
 
419 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.51 
 
 
427 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  49.88 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  47.54 
 
 
626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 
644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.5 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  48.09 
 
 
405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.88 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  47.77 
 
 
413 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  46.91 
 
 
604 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.25 
 
 
406 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
412 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.97 
 
 
419 aa  405  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  46.91 
 
 
604 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.28 
 
 
413 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  49.25 
 
 
408 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  46.52 
 
 
405 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.28 
 
 
413 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.91 
 
 
409 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.76 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.75 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.9 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  46.9 
 
 
404 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.87 
 
 
650 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  47.91 
 
 
661 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  47.87 
 
 
666 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.37 
 
 
666 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>