More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2554 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 		 428 aa  865    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.87 
 
 		 411 aa  568  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.54 
 
 		 419 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  64.05 
 
 		 421 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.59 
 
 		 418 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  63.25 
 
 		 429 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.56 
 
 		 434 aa  522  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.32 
 
 		 441 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.14 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.61 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  57.69 
 
 		 424 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.76 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.74 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.32 
 
 		 443 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  54.74 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.29 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.81 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.09 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.73 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  55.07 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.61 
 
 		 414 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.89 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.5 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.97 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.72 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  52.42 
 
 		 417 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.98 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.44 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.61 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.17 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.92 
 
 		 417 aa  435  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.12 
 
 		 419 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.93 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.46 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  48.71 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.91 
 
 		 420 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.44 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.71 
 
 		 406 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.44 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  48.92 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.21 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.48 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.17 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.09 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  51.93 
 
 		 414 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  50.58 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.48 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  48.91 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.72 
 
 		 413 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.36 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.45 
 
 		 429 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  47.23 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.93 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.86 
 
 		 419 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 423 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.76 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  50.12 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  49.02 
 
 		 406 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.46 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  48.05 
 
 		 417 aa  408  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  51.34 
 
 		 408 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.1 
 
 		 419 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.21 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.92 
 
 		 414 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  49.02 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.24 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  49.02 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  49.02 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  49.02 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.48 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.93 
 
 		 413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  50.24 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  49.02 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.41 
 
 		 413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.17 
 
 		 414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.87 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.53 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  48.78 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.52 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  49.02 
 
 		 406 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.54 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  48.78 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.2 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.63 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.52 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  48.79 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.71 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.7 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  45.95 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.78 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.36 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.71 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.36 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.72 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  43.75 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  45.77 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.93 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>