More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2068 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 		 443 aa  895    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.46 
 
 		 421 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  72.55 
 
 		 424 aa  623  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  71.5 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  68.02 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.57 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.48 
 
 		 435 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.05 
 
 		 441 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.27 
 
 		 442 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.72 
 
 		 421 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.91 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.87 
 
 		 435 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.11 
 
 		 419 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.28 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  59.05 
 
 		 429 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.23 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.37 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  57.04 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.99 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.99 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  60.05 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  58.47 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.74 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.94 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.27 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.66 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.96 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.52 
 
 		 411 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.96 
 
 		 415 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  59.57 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.32 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  56.78 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.24 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  54.55 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.43 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.4 
 
 		 441 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.35 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.2 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.39 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.28 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.72 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.04 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.36 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.32 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.56 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.72 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.21 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  46.68 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.2 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.29 
 
 		 410 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.21 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 416 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.84 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.8 
 
 		 409 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.95 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.94 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.98 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.24 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.69 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  45.11 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  50.72 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.21 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  45.11 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  44.87 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  44.87 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  44.87 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.84 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.8 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.87 
 
 		 406 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.89 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  44.39 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.51 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  44.39 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  44.39 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.65 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.61 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  46.28 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  46.7 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  44.26 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.8 
 
 		 406 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  46.38 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  44.15 
 
 		 406 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.93 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  44.52 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.05 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.89 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.56 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.3 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.24 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  45.35 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  46.97 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  46.22 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  47.17 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  45.22 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  46.19 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  45.39 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>