More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0814 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0814  aminotransferase, class V  100 
 
 		 437 aa  883    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  81.01 
 
 		 412 aa  680    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  81.69 
 
 		 412 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  65.9 
 
 		 409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  49.54 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  49.43 
 
 		 411 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  42.47 
 
 		 412 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  35.76 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  28.97 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  31.22 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  30.48 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  27.61 
 
 		 451 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  30.23 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  30.25 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  29.62 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  31.4 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  30.82 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  26.73 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  29.35 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  28.48 
 
 		 419 aa  143  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  33.02 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  25.95 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  33.95 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  29.66 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  26.07 
 
 		 387 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.02 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  30.96 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.41 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  29.59 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.48 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.07 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.42 
 
 		 429 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.92 
 
 		 429 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.74 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.88 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  27.46 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  29.33 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  29.23 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  32.92 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.29 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  28.6 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.49 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  27.84 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.27 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.82 
 
 		 414 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.91 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.91 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  27.13 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.76 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  25.31 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  27.39 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.99 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.88 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.77 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.83 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  26 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.17 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.78 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.73 
 
 		 604 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.33 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.3 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.93 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.73 
 
 		 604 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.51 
 
 		 435 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.32 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.63 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.64 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.78 
 
 		 679 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  28.25 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.66 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.33 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.39 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.16 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.87 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.52 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.52 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  25.8 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  24.57 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.31 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.44 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.44 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.44 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.52 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.74 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  30.62 
 
 		 688 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.11 
 
 		 572 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.44 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.29 
 
 		 630 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  28.92 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.05 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.27 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.79 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.27 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.01 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  25.27 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.27 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.82 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>