More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0934 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
395 aa  788    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  57.84 
 
 
407 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  46.4 
 
 
414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  45.2 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  44.96 
 
 
410 aa  306  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  45.59 
 
 
410 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  41.18 
 
 
411 aa  289  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  41.05 
 
 
418 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  41.29 
 
 
409 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  41.09 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  50 
 
 
457 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  39.8 
 
 
416 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  38.9 
 
 
419 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  36.16 
 
 
412 aa  258  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  45.65 
 
 
451 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  42.43 
 
 
400 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  40.55 
 
 
399 aa  233  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  39.32 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  38.67 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  40 
 
 
421 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  41.24 
 
 
414 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  37.06 
 
 
400 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  38.77 
 
 
407 aa  200  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  32.81 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  32.69 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  34.32 
 
 
399 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  34.08 
 
 
397 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  34.16 
 
 
399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.52 
 
 
408 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  33.82 
 
 
412 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 
644 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  28.12 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.88 
 
 
428 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.83 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  35.95 
 
 
425 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.41 
 
 
419 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  31.03 
 
 
398 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.74 
 
 
443 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.02 
 
 
413 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.1 
 
 
414 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.36 
 
 
419 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.65 
 
 
433 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3060  aminotransferase, class V  30.73 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.349128  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  31.07 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  26.8 
 
 
665 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.56 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  29.53 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  32.76 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  32.76 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  32.76 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.58 
 
 
409 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.86 
 
 
419 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.38 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.27 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.1 
 
 
441 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.85 
 
 
608 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  30.66 
 
 
429 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  30.54 
 
 
401 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  30.05 
 
 
417 aa  139  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.52 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.26 
 
 
425 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.36 
 
 
435 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.15 
 
 
442 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.2 
 
 
408 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.94 
 
 
604 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.41 
 
 
414 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.94 
 
 
604 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.76 
 
 
418 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  27.2 
 
 
496 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.85 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  29.5 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  31.07 
 
 
424 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.84 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  32.85 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  26.83 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  29.25 
 
 
414 aa  136  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.59 
 
 
442 aa  135  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.61 
 
 
414 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.5 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.29 
 
 
610 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.06 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.68 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  29.31 
 
 
688 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.29 
 
 
560 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.27 
 
 
641 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.95 
 
 
414 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1138  aminotransferase class V  29.95 
 
 
401 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.88 
 
 
435 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.3 
 
 
426 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  30.07 
 
 
417 aa  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.81 
 
 
443 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.07 
 
 
406 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.46 
 
 
605 aa  133  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.61 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.06 
 
 
666 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  30.39 
 
 
412 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.06 
 
 
650 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.48 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 
774 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>