More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0280 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 398 aa  791    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  54.77 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  55.67 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  53.77 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  53.77 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  53.77 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  53.27 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  53.27 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  51.25 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  50.38 
 
 		 399 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  43.32 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  40.3 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  40.05 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  35.26 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  37.88 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  35.43 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  30.15 
 
 		 410 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  27.55 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  28.95 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  32.67 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  30.83 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  27.71 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  28.9 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  27.38 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  28.89 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  28.79 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  27.43 
 
 		 451 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  27.76 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  29.53 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  27.32 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  31.2 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  31.42 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.1 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  30.42 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  27.29 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.75 
 
 		 444 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  24.33 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  28.18 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.83 
 
 		 644 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.07 
 
 		 673 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.21 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.44 
 
 		 664 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  26.89 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.2 
 
 		 449 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  26.1 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  28.78 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.38 
 
 		 605 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.42 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.44 
 
 		 672 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  26 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.44 
 
 		 674 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  23.44 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.83 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  29.16 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.14 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.85 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.07 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.2 
 
 		 621 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.24 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.96 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  24.81 
 
 		 569 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.42 
 
 		 423 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.59 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.9 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.29 
 
 		 604 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.14 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.29 
 
 		 604 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.84 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.85 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.97 
 
 		 679 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.03 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  21.77 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  25.53 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.89 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.51 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  22.48 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.14 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  27.19 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.34 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  26.44 
 
 		 661 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  25.89 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.81 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  23.84 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.56 
 
 		 608 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.34 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.82 
 
 		 414 aa  99.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.95 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.14 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.06 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  25.12 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.28 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  26.95 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  25.54 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  25.64 
 
 		 682 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.7 
 
 		 662 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  32.07 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  24.33 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.94 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>