More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0136 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 399 aa  777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  68.84 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  54.39 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  53.88 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  53.88 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  53.88 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  54.39 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  51.25 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  52.88 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  51.38 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  53.52 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  45 
 
 		 403 aa  292  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  44.64 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  44.69 
 
 		 399 aa  262  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  42.08 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  43.5 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  35.96 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  38.6 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  34.65 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  32.12 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  35.68 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  32.17 
 
 		 457 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  35.77 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  32.51 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  33.74 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  31.04 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  29.67 
 
 		 451 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  27.76 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  34.16 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  29.27 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  32.92 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  35.7 
 
 		 421 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  33.58 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  31.06 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  28.75 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  31.39 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.7 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.01 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.81 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  26.9 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.52 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.33 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.51 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  25.24 
 
 		 419 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.52 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.32 
 
 		 444 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.78 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.81 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.41 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.34 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.33 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.93 
 
 		 664 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.49 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.64 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.22 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.53 
 
 		 572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.12 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  29.41 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  27.01 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.48 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.69 
 
 		 673 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.68 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.37 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  26.37 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.84 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.81 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.29 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.32 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  25.48 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.79 
 
 		 672 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.38 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.29 
 
 		 419 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.79 
 
 		 674 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.98 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  26.37 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.24 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.6 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  26.99 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.9 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.86 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.35 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.35 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  28.44 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  26.13 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  26.93 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.06 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  29.05 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.34 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  29.05 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  27.32 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.24 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  25.42 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.29 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.54 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.46 
 
 		 644 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.02 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.73 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  29.05 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>