More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1188 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 398 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  91.21 
 
 		 398 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  80.65 
 
 		 398 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  80.65 
 
 		 398 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  77.14 
 
 		 398 aa  615  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  80.65 
 
 		 398 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  53.27 
 
 		 398 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  52.88 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  50.63 
 
 		 418 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  49.5 
 
 		 399 aa  358  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  44.22 
 
 		 407 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  39 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  38 
 
 		 403 aa  225  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  35.5 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  35.15 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  32.25 
 
 		 400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  31.55 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  29.34 
 
 		 410 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  33.15 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  28.61 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  27.92 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  29.46 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  31.62 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  28.17 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  29.97 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  28.4 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  29.46 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  30.79 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  32.35 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  28.46 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  31.42 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  26.85 
 
 		 425 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  25 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  23.64 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  28.54 
 
 		 442 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  28.03 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  25.9 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.67 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  28.72 
 
 		 397 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  27.98 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  23.67 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  23.43 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.15 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.69 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.15 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.19 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.49 
 
 		 664 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.1 
 
 		 657 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  25.67 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.42 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.95 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  26.86 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.12 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.14 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.73 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.24 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.36 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.18 
 
 		 605 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.1 
 
 		 662 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  25.24 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.99 
 
 		 621 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.68 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.01 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.29 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.67 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  24.4 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.01 
 
 		 674 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.01 
 
 		 672 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.97 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.18 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.12 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.93 
 
 		 644 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.36 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.19 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  24.82 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.82 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  24.82 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.43 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.56 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.58 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  24.35 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  23.27 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.58 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.82 
 
 		 412 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.41 
 
 		 560 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.59 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.53 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  27 
 
 		 678 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  24.1 
 
 		 665 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  23.69 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  23.15 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.54 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.84 
 
 		 414 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.27 
 
 		 418 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  24.03 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.72 
 
 		 604 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.08 
 
 		 885 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.76 
 
 		 774 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  26.34 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>