More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1815 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.48 
 
 
644 aa  709    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  74.44 
 
 
604 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.18 
 
 
610 aa  718    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  74.44 
 
 
604 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  75 
 
 
666 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  66 
 
 
626 aa  638    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  72.35 
 
 
621 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  71.75 
 
 
682 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  70.23 
 
 
688 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.3 
 
 
560 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  100 
 
 
665 aa  1373    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  75 
 
 
666 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  75.5 
 
 
650 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  54.48 
 
 
661 aa  663    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.36 
 
 
605 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.1 
 
 
630 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.65 
 
 
641 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  73.18 
 
 
679 aa  628  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.81 
 
 
678 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.05 
 
 
662 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  69.1 
 
 
657 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  70.44 
 
 
941 aa  609  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  71.18 
 
 
608 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  70.63 
 
 
660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  70.86 
 
 
671 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  69.34 
 
 
685 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  70.86 
 
 
660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.31 
 
 
629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  69.34 
 
 
660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  70.86 
 
 
660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  70.86 
 
 
660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.41 
 
 
774 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.1 
 
 
444 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.87 
 
 
664 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.8 
 
 
674 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.2 
 
 
673 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.8 
 
 
672 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  54.95 
 
 
420 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.71 
 
 
408 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.72 
 
 
451 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.7 
 
 
418 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.45 
 
 
404 aa  462  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.69 
 
 
404 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.73 
 
 
412 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.07 
 
 
413 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  49.5 
 
 
419 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  50.64 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  51.73 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  51.73 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  50.51 
 
 
405 aa  442  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  50.51 
 
 
405 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.25 
 
 
429 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  49.62 
 
 
414 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.74 
 
 
414 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
429 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.62 
 
 
413 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.26 
 
 
429 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.96 
 
 
416 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.12 
 
 
421 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.62 
 
 
404 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  50.25 
 
 
414 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
414 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 
414 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.89 
 
 
413 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.38 
 
 
414 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  49.5 
 
 
414 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.75 
 
 
406 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 
425 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  48.44 
 
 
422 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.75 
 
 
406 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.75 
 
 
406 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.4 
 
 
427 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.25 
 
 
406 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.88 
 
 
419 aa  425  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 
428 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
415 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  49.25 
 
 
413 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  49.5 
 
 
415 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  49.01 
 
 
414 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.5 
 
 
406 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.25 
 
 
406 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.75 
 
 
406 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  49.14 
 
 
412 aa  424  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  51.25 
 
 
406 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.25 
 
 
406 aa  422  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  51.25 
 
 
406 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51 
 
 
406 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  52.33 
 
 
417 aa  422  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
415 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 
415 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.25 
 
 
406 aa  422  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.25 
 
 
406 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
417 aa  422  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51 
 
 
406 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.74 
 
 
414 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  49.5 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.38 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
408 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50 
 
 
406 aa  419  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>