More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2487 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  100 
 
 		 420 aa  865    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  66.26 
 
 		 414 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.94 
 
 		 451 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.24 
 
 		 404 aa  556  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  60.45 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.87 
 
 		 418 aa  532  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  60.3 
 
 		 405 aa  529  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  60.3 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.81 
 
 		 412 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.66 
 
 		 774 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.04 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.5 
 
 		 421 aa  518  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.17 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  59.45 
 
 		 626 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.56 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.16 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.57 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.57 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.96 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.87 
 
 		 621 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.75 
 
 		 444 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.82 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.65 
 
 		 662 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.5 
 
 		 657 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  55.4 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.06 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.79 
 
 		 641 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  57.28 
 
 		 682 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.21 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.04 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  56.14 
 
 		 604 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.68 
 
 		 404 aa  492  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  56.5 
 
 		 688 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  54.95 
 
 		 665 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.82 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  56.14 
 
 		 604 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.26 
 
 		 610 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.14 
 
 		 629 aa  488  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  55.69 
 
 		 661 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.36 
 
 		 605 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.53 
 
 		 673 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  56.14 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  56.75 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  56 
 
 		 678 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.78 
 
 		 664 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.11 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.5 
 
 		 650 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.86 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.25 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.14 
 
 		 560 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  54.09 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.36 
 
 		 679 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  55 
 
 		 666 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  55 
 
 		 672 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55 
 
 		 674 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  56.83 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  56.83 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  54.5 
 
 		 666 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.92 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.32 
 
 		 414 aa  474  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.25 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.06 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.98 
 
 		 644 aa  468  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.19 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.47 
 
 		 414 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.87 
 
 		 406 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.7 
 
 		 608 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.23 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  52.21 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  53.85 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.23 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.9 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.47 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  52.45 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  54.03 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.16 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  55.98 
 
 		 685 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.36 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.7 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.39 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.73 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.36 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.92 
 
 		 941 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.53 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  55.73 
 
 		 671 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  52.96 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  55.98 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.16 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  55.73 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  55.73 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  55.73 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.49 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  55.73 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.38 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  52 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.87 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.35 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.02 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.23 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.83 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>