More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4075 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 400 aa  787    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  59.05 
 
 		 400 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  53.79 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  58 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  49.37 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  48.88 
 
 		 403 aa  292  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  43.21 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  44.61 
 
 		 407 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  40.69 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  41.88 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  39.81 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  37.28 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  41.27 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  38.78 
 
 		 418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  40 
 
 		 410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  39.51 
 
 		 416 aa  252  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  39.06 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  34.23 
 
 		 451 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  35.8 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  39.75 
 
 		 421 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  33.08 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  38.6 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  39.44 
 
 		 407 aa  205  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  37.06 
 
 		 395 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  35.49 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  37.47 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  36.39 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  33.17 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  34.75 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  34.75 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  34.75 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  33.25 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  32.35 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  34.47 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  32.25 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  32.67 
 
 		 398 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.4 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.48 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.95 
 
 		 412 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  32.08 
 
 		 429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  34 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  30.12 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.15 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  28.89 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.15 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  31.65 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.39 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  31.16 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.18 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  31.53 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.65 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.93 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.16 
 
 		 641 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.93 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.62 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  33.43 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  29.67 
 
 		 413 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  31.36 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.63 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.94 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.93 
 
 		 608 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.72 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  28.19 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.84 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.62 
 
 		 630 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.96 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  30.29 
 
 		 682 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  30.43 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.64 
 
 		 419 aa  130  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.1 
 
 		 425 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.91 
 
 		 417 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.93 
 
 		 441 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  30.05 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.6 
 
 		 413 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.98 
 
 		 679 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.59 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  25.65 
 
 		 414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  27.06 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.06 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  32.12 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.89 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.38 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.56 
 
 		 439 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  27.06 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.57 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  30 
 
 		 650 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  30.24 
 
 		 661 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.43 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.19 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.98 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.59 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.06 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.05 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.36 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.82 
 
 		 406 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  27.65 
 
 		 403 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  27.08 
 
 		 569 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.76 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.76 
 
 		 406 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>