More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2736 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  80.24 
 
 
417 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.09 
 
 
419 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  80.29 
 
 
417 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  80.24 
 
 
417 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  80.24 
 
 
417 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
415 aa  836    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  69.21 
 
 
421 aa  591  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  69.38 
 
 
426 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  66.35 
 
 
429 aa  544  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.56 
 
 
425 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.77 
 
 
421 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.74 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.34 
 
 
449 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.07 
 
 
435 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  62.35 
 
 
424 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.38 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.77 
 
 
446 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  57.83 
 
 
441 aa  482  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.96 
 
 
443 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.16 
 
 
442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  55.56 
 
 
421 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.77 
 
 
441 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  58.85 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.44 
 
 
442 aa  458  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.27 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.31 
 
 
419 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  59.23 
 
 
435 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.39 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.04 
 
 
443 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  53.33 
 
 
429 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.76 
 
 
441 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.37 
 
 
411 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.84 
 
 
434 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.93 
 
 
428 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.36 
 
 
434 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.25 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  48.77 
 
 
452 aa  392  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  50.74 
 
 
414 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.44 
 
 
414 aa  388  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.24 
 
 
408 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.69 
 
 
414 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.4 
 
 
414 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.94 
 
 
417 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.26 
 
 
412 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  46.55 
 
 
426 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.78 
 
 
451 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.08 
 
 
412 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.51 
 
 
429 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  49.17 
 
 
424 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.76 
 
 
429 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.93 
 
 
427 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  48.77 
 
 
413 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.73 
 
 
415 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.27 
 
 
429 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.87 
 
 
420 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.55 
 
 
417 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.26 
 
 
408 aa  366  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.78 
 
 
412 aa  364  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  44.96 
 
 
428 aa  364  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.37 
 
 
414 aa  363  4e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  44.5 
 
 
420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  39.85 
 
 
419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.6 
 
 
416 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.89 
 
 
420 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  45 
 
 
419 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  45.7 
 
 
417 aa  361  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.21 
 
 
406 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.83 
 
 
657 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.7 
 
 
420 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  46 
 
 
406 aa  359  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.04 
 
 
417 aa  358  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  45.01 
 
 
423 aa  358  8e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.74 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.99 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.94 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.54 
 
 
774 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.99 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  47.3 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.21 
 
 
406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  45.97 
 
 
682 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  44.33 
 
 
434 aa  356  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.21 
 
 
406 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.21 
 
 
406 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.45 
 
 
406 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.21 
 
 
406 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  45.83 
 
 
422 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.96 
 
 
413 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.96 
 
 
413 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.97 
 
 
406 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.32 
 
 
406 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.48 
 
 
419 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.7 
 
 
413 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  42.05 
 
 
420 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.32 
 
 
409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.32 
 
 
406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  45.48 
 
 
688 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.25 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.99 
 
 
407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  42.72 
 
 
413 aa  353  4e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.08 
 
 
406 aa  352  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>