More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  82.05 
 
 		 449 aa  691    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  76.72 
 
 		 432 aa  652    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  82.08 
 
 		 446 aa  651    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  100 
 
 		 435 aa  862    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  76.9 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  62.41 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.41 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  61.72 
 
 		 429 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.1 
 
 		 419 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.55 
 
 		 425 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.99 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.26 
 
 		 421 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.72 
 
 		 421 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.13 
 
 		 442 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.99 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.99 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.51 
 
 		 443 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.99 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  59.66 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.96 
 
 		 426 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.71 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.24 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.73 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  59.86 
 
 		 441 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.13 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  56.4 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  56.14 
 
 		 452 aa  472  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.24 
 
 		 442 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.93 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  52.66 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  51.57 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.97 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  55.42 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.17 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.8 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.84 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.32 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  52.3 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.95 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.24 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.64 
 
 		 414 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.28 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.06 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.08 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.73 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.04 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.7 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  43.06 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.91 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  47 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.84 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.68 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  45.89 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.67 
 
 		 417 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.84 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  46.25 
 
 		 417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  45.89 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  48.2 
 
 		 408 aa  362  9e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.21 
 
 		 414 aa  361  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  44.26 
 
 		 420 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.64 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  43.78 
 
 		 423 aa  360  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.68 
 
 		 415 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.2 
 
 		 406 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 417 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.77 
 
 		 408 aa  354  1e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.43 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  40.82 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.54 
 
 		 414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.94 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.07 
 
 		 406 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  45.89 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.94 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  40.1 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  44.23 
 
 		 419 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.84 
 
 		 414 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  40.1 
 
 		 416 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.06 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.46 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  37.5 
 
 		 425 aa  348  9e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  42.11 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.17 
 
 		 629 aa  346  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.99 
 
 		 427 aa  346  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.44 
 
 		 420 aa  346  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 406 aa  345  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  43.9 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  43.9 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  40.72 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.93 
 
 		 657 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  40.72 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.19 
 
 		 408 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.24 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.65 
 
 		 409 aa  342  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 662 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.24 
 
 		 412 aa  342  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.28 
 
 		 774 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>