More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2446 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  100 
 
 
429 aa  881    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  74.22 
 
 
434 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  75.6 
 
 
434 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  66.51 
 
 
421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.91 
 
 
419 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.37 
 
 
441 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.76 
 
 
442 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.22 
 
 
411 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.25 
 
 
428 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.11 
 
 
435 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.83 
 
 
418 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  60.53 
 
 
424 aa  528  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.84 
 
 
421 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.62 
 
 
433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.51 
 
 
435 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.05 
 
 
443 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  57.67 
 
 
429 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.31 
 
 
425 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  56.22 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.44 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.13 
 
 
435 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.66 
 
 
421 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.37 
 
 
414 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.29 
 
 
442 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.35 
 
 
419 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.73 
 
 
429 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.16 
 
 
414 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.44 
 
 
412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.39 
 
 
426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  53.08 
 
 
417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.15 
 
 
449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.92 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.53 
 
 
429 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.77 
 
 
429 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  52.1 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.57 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.81 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.57 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  52.07 
 
 
414 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.28 
 
 
406 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.33 
 
 
415 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
420 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.36 
 
 
417 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.06 
 
 
432 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  49.05 
 
 
414 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.95 
 
 
419 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  49.76 
 
 
420 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.95 
 
 
419 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
443 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
414 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
451 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.71 
 
 
406 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  47.6 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  51.45 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.96 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  46.89 
 
 
423 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.2 
 
 
408 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  51.81 
 
 
422 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.72 
 
 
414 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
414 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.95 
 
 
406 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.38 
 
 
414 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  47.71 
 
 
406 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  47.71 
 
 
406 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  47.95 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  47.71 
 
 
406 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.64 
 
 
413 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  47.95 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.27 
 
 
420 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  47.95 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  47.95 
 
 
406 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.99 
 
 
406 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.67 
 
 
404 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.36 
 
 
414 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  47.95 
 
 
406 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.74 
 
 
408 aa  408  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  48.79 
 
 
413 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.13 
 
 
417 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.64 
 
 
419 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  50.12 
 
 
414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.64 
 
 
414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  47.71 
 
 
406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  49.76 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.28 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.64 
 
 
413 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.16 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.29 
 
 
404 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
425 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.28 
 
 
413 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  46.38 
 
 
419 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  49.64 
 
 
414 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.23 
 
 
412 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.76 
 
 
427 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.3 
 
 
446 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.04 
 
 
418 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.16 
 
 
413 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  45.43 
 
 
420 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.06 
 
 
421 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.15 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.68 
 
 
657 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>