More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2386 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  81.38 
 
 		 421 aa  687    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 		 426 aa  858    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  70.57 
 
 		 417 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  70.81 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  70.81 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  70.56 
 
 		 419 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.38 
 
 		 415 aa  586  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  69.49 
 
 		 417 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.65 
 
 		 435 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.01 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  67.15 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  70.28 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.34 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  65.73 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.91 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  60.93 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.89 
 
 		 435 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.85 
 
 		 442 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.29 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.93 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  59 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.97 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.67 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.53 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  55.69 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  60.72 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.28 
 
 		 443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  59.28 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.25 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  54.5 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.72 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.57 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.91 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.15 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.72 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.97 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.06 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.14 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  48.98 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  49.4 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.36 
 
 		 417 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.24 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.78 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.24 
 
 		 414 aa  395  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  46.36 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.71 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.03 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.52 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.91 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.09 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  45.05 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.27 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  47.58 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.7 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.03 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 413 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.26 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.27 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.87 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  47.71 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  47.84 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  47.71 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.12 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.17 
 
 		 414 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.23 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.52 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.44 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  46.93 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.15 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  47.33 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.76 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  45.85 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.24 
 
 		 657 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.19 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.26 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  42.48 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  45.2 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  46.02 
 
 		 420 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.38 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.45 
 
 		 629 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  49.76 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.66 
 
 		 413 aa  375  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.99 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.8 
 
 		 413 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.06 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.38 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  44.1 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  39.66 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.41 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.14 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  45.5 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  43.65 
 
 		 423 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.72 
 
 		 621 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.63 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.78 
 
 		 605 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.91 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.68 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>