More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1465 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  79.18 
 
 
414 aa  687    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  78.93 
 
 
414 aa  686    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  84.5 
 
 
413 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  82.92 
 
 
416 aa  712    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  78.4 
 
 
413 aa  692    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  84.02 
 
 
413 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  78.45 
 
 
414 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
413 aa  854    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  68.07 
 
 
415 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.17 
 
 
415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.07 
 
 
414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.67 
 
 
428 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  63.11 
 
 
414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.13 
 
 
414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.93 
 
 
415 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  65.62 
 
 
413 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  64.94 
 
 
414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.27 
 
 
420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.94 
 
 
415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.71 
 
 
413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.19 
 
 
414 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.46 
 
 
413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.04 
 
 
418 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.79 
 
 
418 aa  554  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.01 
 
 
426 aa  548  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.78 
 
 
414 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.44 
 
 
419 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  62.38 
 
 
406 aa  538  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.07 
 
 
407 aa  534  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.87 
 
 
406 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  62.38 
 
 
406 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.13 
 
 
406 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  61.14 
 
 
406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.39 
 
 
403 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.02 
 
 
408 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.72 
 
 
413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  54.93 
 
 
414 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.98 
 
 
429 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.48 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  51.49 
 
 
422 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.32 
 
 
451 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.24 
 
 
416 aa  435  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.25 
 
 
408 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  49.88 
 
 
420 aa  428  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  51 
 
 
419 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  52.77 
 
 
421 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  50.5 
 
 
405 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  50.5 
 
 
405 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
417 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.5 
 
 
406 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51 
 
 
412 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.1 
 
 
421 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.98 
 
 
629 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.26 
 
 
404 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.01 
 
 
662 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.88 
 
 
657 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.64 
 
 
414 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  48.53 
 
 
423 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.51 
 
 
404 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.23 
 
 
416 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.64 
 
 
678 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.77 
 
 
419 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  48.28 
 
 
420 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.79 
 
 
434 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.88 
 
 
420 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
406 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  50.96 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.36 
 
 
673 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.63 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.86 
 
 
664 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.38 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
621 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.67 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
774 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  49.38 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.09 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  49.38 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  47.78 
 
 
413 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  49.38 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  49.38 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  49.38 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  49.38 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  49.38 
 
 
406 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  48.39 
 
 
626 aa  411  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
429 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  49.38 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  49.38 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.59 
 
 
418 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49 
 
 
419 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.49 
 
 
427 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.51 
 
 
419 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  47.54 
 
 
420 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 
415 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.75 
 
 
418 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.38 
 
 
429 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  47.01 
 
 
419 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.38 
 
 
429 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.02 
 
 
650 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>