More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3312 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 
415 aa  836    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.99 
 
 
414 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  58.09 
 
 
422 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.27 
 
 
429 aa  448  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.03 
 
 
429 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.85 
 
 
414 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.94 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.96 
 
 
408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.03 
 
 
429 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.52 
 
 
429 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  53.27 
 
 
413 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  51.92 
 
 
414 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.58 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  53.4 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.09 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.41 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  53.73 
 
 
420 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.12 
 
 
415 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  53.37 
 
 
415 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.45 
 
 
413 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.93 
 
 
413 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.7 
 
 
420 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.36 
 
 
418 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.65 
 
 
404 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.4 
 
 
428 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
413 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.98 
 
 
418 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.36 
 
 
418 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.45 
 
 
421 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  50.75 
 
 
404 aa  428  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.16 
 
 
415 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  49.39 
 
 
414 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
414 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  51.83 
 
 
421 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.76 
 
 
414 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  48.9 
 
 
405 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.5 
 
 
426 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.2 
 
 
415 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  48.9 
 
 
405 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  49.15 
 
 
414 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  55 
 
 
414 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.28 
 
 
425 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.98 
 
 
414 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.62 
 
 
416 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.26 
 
 
406 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
413 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  48.14 
 
 
420 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.37 
 
 
406 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
419 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.74 
 
 
413 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.13 
 
 
404 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  46.5 
 
 
425 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  46.98 
 
 
414 aa  408  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.07 
 
 
417 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
413 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.39 
 
 
418 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  47.89 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  48.2 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.99 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.31 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  47.24 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.36 
 
 
413 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.49 
 
 
407 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  47.09 
 
 
604 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.98 
 
 
406 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.23 
 
 
412 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.98 
 
 
406 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.6 
 
 
404 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.65 
 
 
419 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.86 
 
 
412 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.98 
 
 
406 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.4 
 
 
419 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.36 
 
 
413 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  47.09 
 
 
604 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.47 
 
 
441 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.99 
 
 
406 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.63 
 
 
417 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  50.49 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.49 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.23 
 
 
560 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.73 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.24 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  48.26 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  47.88 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.24 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.24 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.85 
 
 
411 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.49 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.98 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.27 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  50.49 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50 
 
 
406 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  47.49 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  47.24 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.24 
 
 
406 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.98 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.76 
 
 
406 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>