More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0617 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  70.23 
 
 
604 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.29 
 
 
630 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  73.71 
 
 
666 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  73.82 
 
 
626 aa  641    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
621 aa  1261    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  73.73 
 
 
682 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  73.25 
 
 
688 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  72.35 
 
 
665 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  73.89 
 
 
666 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.67 
 
 
650 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  70.23 
 
 
604 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.95 
 
 
605 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  72.95 
 
 
679 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  63.36 
 
 
661 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  74.57 
 
 
610 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  71.95 
 
 
641 aa  630  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  70.26 
 
 
560 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.43 
 
 
608 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.89 
 
 
774 aa  616  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.92 
 
 
941 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.22 
 
 
662 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.71 
 
 
644 aa  617  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.2 
 
 
629 aa  617  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.35 
 
 
657 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  72.37 
 
 
660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  72.13 
 
 
685 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  72.13 
 
 
660 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  72.13 
 
 
671 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  72.13 
 
 
660 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  72.13 
 
 
660 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.61 
 
 
678 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  72.13 
 
 
660 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.09 
 
 
444 aa  555  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.09 
 
 
673 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  65 
 
 
664 aa  545  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.38 
 
 
674 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.38 
 
 
672 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  57.87 
 
 
420 aa  508  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.83 
 
 
408 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.53 
 
 
418 aa  485  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.21 
 
 
451 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.81 
 
 
412 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.45 
 
 
404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.5 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.7 
 
 
414 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  51.68 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.16 
 
 
415 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  52.71 
 
 
405 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.12 
 
 
419 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  50.62 
 
 
419 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  52.71 
 
 
405 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.26 
 
 
404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.63 
 
 
429 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.36 
 
 
416 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.01 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.24 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.99 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  51.65 
 
 
412 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  52.26 
 
 
413 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.36 
 
 
425 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.14 
 
 
413 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.28 
 
 
413 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.24 
 
 
429 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  51.13 
 
 
414 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  51.13 
 
 
414 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  52.76 
 
 
405 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.29 
 
 
421 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.26 
 
 
414 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.37 
 
 
413 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.33 
 
 
427 aa  432  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  53.19 
 
 
417 aa  432  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.23 
 
 
415 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  50.74 
 
 
415 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.01 
 
 
413 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.52 
 
 
414 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  50 
 
 
414 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.88 
 
 
418 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.76 
 
 
428 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
414 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.88 
 
 
418 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.62 
 
 
414 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.63 
 
 
417 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.26 
 
 
416 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
413 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.13 
 
 
406 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  50.75 
 
 
422 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
420 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 
415 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.75 
 
 
417 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.77 
 
 
426 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  49.5 
 
 
414 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.5 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  49.75 
 
 
414 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
415 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.13 
 
 
414 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.5 
 
 
407 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51 
 
 
406 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51 
 
 
406 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  46.41 
 
 
420 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>