More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4001 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  68.37 
 
 
661 aa  829    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  78.88 
 
 
660 aa  901    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  79.03 
 
 
660 aa  902    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  77.97 
 
 
671 aa  914    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  78.73 
 
 
660 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.41 
 
 
641 aa  741    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  77.83 
 
 
685 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  73.26 
 
 
941 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  97.6 
 
 
666 aa  1263    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  73.89 
 
 
621 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  74.78 
 
 
682 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  74.93 
 
 
688 aa  957    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  73.13 
 
 
605 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  53.09 
 
 
665 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  78.88 
 
 
660 aa  901    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.68 
 
 
630 aa  822    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  98.46 
 
 
650 aa  1234    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.75 
 
 
608 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  58.11 
 
 
604 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
666 aa  1333    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.91 
 
 
679 aa  819    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  78.88 
 
 
660 aa  901    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  58.27 
 
 
604 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  72.43 
 
 
626 aa  634  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  72.03 
 
 
678 aa  625  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  71.53 
 
 
657 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.39 
 
 
610 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  71.46 
 
 
662 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  71.04 
 
 
560 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.48 
 
 
644 aa  605  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.08 
 
 
774 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.18 
 
 
629 aa  595  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.95 
 
 
444 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.75 
 
 
664 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.2 
 
 
673 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.1 
 
 
672 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.1 
 
 
674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.84 
 
 
451 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.88 
 
 
408 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  55 
 
 
420 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.8 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.39 
 
 
412 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.5 
 
 
404 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  50.25 
 
 
419 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.37 
 
 
414 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.64 
 
 
404 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.64 
 
 
416 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.19 
 
 
413 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.52 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  52.01 
 
 
413 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.52 
 
 
429 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.02 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.86 
 
 
415 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.93 
 
 
413 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.42 
 
 
413 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  49.11 
 
 
425 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.15 
 
 
419 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.51 
 
 
414 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
404 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.62 
 
 
429 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  51.76 
 
 
414 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  50.63 
 
 
414 aa  432  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  50.63 
 
 
414 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  49.49 
 
 
405 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.6 
 
 
425 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.64 
 
 
428 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.12 
 
 
415 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  51.87 
 
 
415 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  49.49 
 
 
405 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  50.62 
 
 
404 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  49.37 
 
 
412 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  51.26 
 
 
414 aa  428  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.62 
 
 
414 aa  428  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.76 
 
 
413 aa  429  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.11 
 
 
421 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.26 
 
 
415 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.75 
 
 
427 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.87 
 
 
415 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.87 
 
 
408 aa  425  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  53.37 
 
 
417 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.13 
 
 
417 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  51.13 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  50.12 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
414 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.62 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  50.25 
 
 
406 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
406 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  48.73 
 
 
406 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  48.73 
 
 
406 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  50.25 
 
 
406 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.25 
 
 
406 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  48.03 
 
 
422 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.25 
 
 
406 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.25 
 
 
406 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.74 
 
 
414 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.37 
 
 
414 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.62 
 
 
418 aa  415  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
416 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>