More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1761 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  100 
 
 
406 aa  841    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  99.01 
 
 
406 aa  831    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  87.68 
 
 
406 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  87.44 
 
 
406 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  841    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  98.03 
 
 
406 aa  820    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  98.52 
 
 
406 aa  827    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  98.77 
 
 
406 aa  829    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  87.19 
 
 
406 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  87.44 
 
 
406 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  87.68 
 
 
406 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  99.75 
 
 
406 aa  839    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  100 
 
 
406 aa  841    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  82.76 
 
 
406 aa  715    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  99.01 
 
 
406 aa  831    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  71.18 
 
 
406 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  70.44 
 
 
406 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  70.2 
 
 
407 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  70.2 
 
 
407 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  69.95 
 
 
406 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  70.2 
 
 
406 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.81 
 
 
417 aa  591  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0462  cysteine desulfurase  61.08 
 
 
407 aa  546  1e-154  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.84 
 
 
414 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.99 
 
 
406 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  52.84 
 
 
420 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.97 
 
 
416 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.58 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  51.25 
 
 
405 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  51.5 
 
 
405 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.12 
 
 
404 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.63 
 
 
404 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.97 
 
 
429 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.97 
 
 
417 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.46 
 
 
418 aa  431  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
429 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.23 
 
 
429 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.63 
 
 
408 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 
404 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  48.62 
 
 
425 aa  428  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  51 
 
 
413 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.98 
 
 
429 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  51.75 
 
 
604 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.27 
 
 
427 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.74 
 
 
406 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  51.75 
 
 
604 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.02 
 
 
415 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  48.4 
 
 
419 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  51.25 
 
 
665 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.14 
 
 
408 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.58 
 
 
414 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.62 
 
 
444 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.11 
 
 
605 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  49.24 
 
 
406 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  49.24 
 
 
406 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  50.74 
 
 
414 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  50.74 
 
 
414 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  49.24 
 
 
406 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.25 
 
 
406 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  49.24 
 
 
406 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.84 
 
 
421 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.09 
 
 
414 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  49.24 
 
 
406 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.14 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  48.99 
 
 
406 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  48.99 
 
 
406 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  48.99 
 
 
406 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.99 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.87 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  50.5 
 
 
682 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  50.5 
 
 
688 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.37 
 
 
662 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 
650 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.62 
 
 
657 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  50.75 
 
 
661 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  51 
 
 
666 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  48.74 
 
 
406 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.38 
 
 
629 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
666 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  51 
 
 
621 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.4 
 
 
406 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  48.4 
 
 
412 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.49 
 
 
414 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.67 
 
 
413 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  49.63 
 
 
626 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.25 
 
 
774 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.5 
 
 
630 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.63 
 
 
678 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
414 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.65 
 
 
420 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.67 
 
 
413 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  49.75 
 
 
404 aa  408  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.75 
 
 
941 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  47.91 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  50.75 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.75 
 
 
610 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.87 
 
 
412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.75 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 
608 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>