More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0728 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
421 aa  861    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  64.71 
 
 
414 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.11 
 
 
416 aa  548  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  62.5 
 
 
420 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.23 
 
 
451 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.52 
 
 
427 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  57.58 
 
 
425 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.15 
 
 
429 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.58 
 
 
404 aa  502  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.51 
 
 
429 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.78 
 
 
429 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  60 
 
 
429 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.95 
 
 
408 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  57.64 
 
 
405 aa  491  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  57.64 
 
 
405 aa  491  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.66 
 
 
419 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.7 
 
 
413 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.33 
 
 
412 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.58 
 
 
414 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.17 
 
 
418 aa  485  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.33 
 
 
404 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  57.92 
 
 
422 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.99 
 
 
416 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.25 
 
 
415 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.53 
 
 
417 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  54.98 
 
 
404 aa  474  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  55.33 
 
 
414 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.58 
 
 
413 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  54.84 
 
 
414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  55.45 
 
 
414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  55.45 
 
 
414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.34 
 
 
414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.84 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.25 
 
 
664 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.25 
 
 
673 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  52.31 
 
 
419 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.33 
 
 
674 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.33 
 
 
672 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  54.09 
 
 
405 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  53.98 
 
 
414 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.16 
 
 
409 aa  461  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.47 
 
 
413 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.2 
 
 
408 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  54.3 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.98 
 
 
414 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.75 
 
 
629 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53 
 
 
774 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  54.93 
 
 
417 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  52.36 
 
 
412 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.02 
 
 
404 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.43 
 
 
414 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  53.75 
 
 
626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.13 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.85 
 
 
406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  55.09 
 
 
682 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.23 
 
 
415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.31 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.73 
 
 
406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.82 
 
 
413 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.29 
 
 
621 aa  448  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  54.59 
 
 
688 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  53.2 
 
 
413 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.25 
 
 
407 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  52.12 
 
 
665 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  54.84 
 
 
661 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  54.03 
 
 
604 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.2 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.36 
 
 
406 aa  448  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.13 
 
 
444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  54 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.59 
 
 
650 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  54.03 
 
 
604 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.96 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.38 
 
 
941 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.5 
 
 
407 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.36 
 
 
418 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.45 
 
 
415 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.36 
 
 
418 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.85 
 
 
406 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.49 
 
 
415 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.85 
 
 
406 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.11 
 
 
666 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.85 
 
 
406 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.71 
 
 
406 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.85 
 
 
406 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.31 
 
 
415 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.61 
 
 
405 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.35 
 
 
419 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.09 
 
 
406 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.09 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  53.6 
 
 
666 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.09 
 
 
406 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.74 
 
 
678 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.12 
 
 
662 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.84 
 
 
406 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.86 
 
 
420 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  52.23 
 
 
416 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.1 
 
 
413 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.22 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.6 
 
 
406 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>