More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1863 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.59 
 
 		 419 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 		 416 aa  851    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  61.04 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.34 
 
 		 451 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  59.52 
 
 		 414 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.74 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.23 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.39 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.49 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  56.9 
 
 		 419 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.44 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.23 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.99 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.36 
 
 		 657 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  57.5 
 
 		 626 aa  488  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.88 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  54.46 
 
 		 413 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.71 
 
 		 662 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.07 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  53.77 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.53 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.97 
 
 		 644 aa  482  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  57.64 
 
 		 688 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.49 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.75 
 
 		 774 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  54.46 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  56.89 
 
 		 682 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.14 
 
 		 650 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.39 
 
 		 679 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.61 
 
 		 629 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.7 
 
 		 420 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  53.09 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  57.39 
 
 		 666 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  56.68 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.45 
 
 		 444 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.64 
 
 		 666 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.4 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.61 
 
 		 641 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.09 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.86 
 
 		 678 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.36 
 
 		 621 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.72 
 
 		 605 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.09 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  53.88 
 
 		 412 aa  471  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.09 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.96 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.39 
 
 		 630 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  54.59 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  52.94 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.84 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.08 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  52.94 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.25 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  55.85 
 
 		 661 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  56.57 
 
 		 604 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  53.01 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  56.57 
 
 		 604 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  54.96 
 
 		 665 aa  467  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.13 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.81 
 
 		 560 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.72 
 
 		 413 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  52.53 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.61 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.23 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.22 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  54.28 
 
 		 416 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.72 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  56.61 
 
 		 660 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.85 
 
 		 608 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  56.36 
 
 		 671 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  56.36 
 
 		 685 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.88 
 
 		 664 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.1 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.4 
 
 		 673 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  56.36 
 
 		 660 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  56.36 
 
 		 660 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  56.36 
 
 		 660 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  56.36 
 
 		 660 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.44 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.36 
 
 		 674 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  55.69 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.36 
 
 		 672 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.06 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.73 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.78 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.85 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.81 
 
 		 610 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.35 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  55.58 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  53.09 
 
 		 414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  53.09 
 
 		 414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.21 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.23 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.33 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.8 
 
 		 941 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  48.64 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.51 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.76 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>