More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  100 
 
 
425 aa  849    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.51 
 
 
435 aa  537  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  63.1 
 
 
424 aa  534  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.4 
 
 
433 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  64.05 
 
 
429 aa  524  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.26 
 
 
421 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.68 
 
 
421 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.97 
 
 
425 aa  504  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  58.89 
 
 
421 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.57 
 
 
443 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.8 
 
 
417 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.8 
 
 
417 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.33 
 
 
417 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.33 
 
 
442 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  61.37 
 
 
417 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.48 
 
 
441 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  56.22 
 
 
429 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  56.85 
 
 
441 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.63 
 
 
419 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.84 
 
 
442 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.45 
 
 
418 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.73 
 
 
419 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.57 
 
 
415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.28 
 
 
426 aa  467  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.07 
 
 
428 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.57 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.81 
 
 
435 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.43 
 
 
449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.09 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.38 
 
 
443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.04 
 
 
411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.42 
 
 
432 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.21 
 
 
441 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  52.67 
 
 
414 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  50.36 
 
 
434 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.91 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.92 
 
 
406 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.6 
 
 
414 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.6 
 
 
414 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.76 
 
 
406 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.53 
 
 
412 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  52.42 
 
 
408 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.38 
 
 
435 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  55.19 
 
 
435 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.33 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.72 
 
 
412 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  50.24 
 
 
428 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.14 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.93 
 
 
429 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.42 
 
 
429 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.8 
 
 
406 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.55 
 
 
412 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.32 
 
 
406 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.55 
 
 
419 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  45.56 
 
 
406 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  46.36 
 
 
417 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  45.56 
 
 
406 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.67 
 
 
413 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.69 
 
 
429 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.07 
 
 
408 aa  393  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  45.56 
 
 
406 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.03 
 
 
417 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.93 
 
 
416 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  46.86 
 
 
413 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  45.32 
 
 
406 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  45.32 
 
 
406 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  45.32 
 
 
406 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  45.32 
 
 
406 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  49.02 
 
 
426 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  47.71 
 
 
416 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  45.32 
 
 
406 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.78 
 
 
418 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  43.07 
 
 
419 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.86 
 
 
417 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.78 
 
 
418 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  45.08 
 
 
406 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  54 
 
 
409 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.14 
 
 
413 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.65 
 
 
413 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.79 
 
 
414 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.65 
 
 
413 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.06 
 
 
420 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.19 
 
 
414 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.2 
 
 
425 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.25 
 
 
417 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  45.08 
 
 
420 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  44.87 
 
 
423 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  46.15 
 
 
419 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.67 
 
 
414 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  47.83 
 
 
413 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.51 
 
 
420 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.13 
 
 
417 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.07 
 
 
408 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  46.02 
 
 
410 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  47.71 
 
 
414 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.45 
 
 
418 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  45.06 
 
 
420 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.33 
 
 
419 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  47.71 
 
 
414 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.89 
 
 
426 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>