More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3306 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  96.07 
 
 		 434 aa  854    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 		 434 aa  887    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  75.6 
 
 		 429 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.98 
 
 		 441 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  66.43 
 
 		 421 aa  569  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.19 
 
 		 419 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.95 
 
 		 442 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.67 
 
 		 435 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.65 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.41 
 
 		 418 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.56 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.83 
 
 		 421 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.94 
 
 		 411 aa  521  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  60.96 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  59.52 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.74 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.97 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.26 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.49 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.99 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.25 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.55 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  54.57 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.59 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.46 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.73 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.98 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.6 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.61 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.38 
 
 		 442 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.79 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  52.46 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.52 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  48.8 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.67 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  52.16 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  51.07 
 
 		 417 aa  425  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  47.95 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  51.57 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.9 
 
 		 417 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.24 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.91 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.8 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.58 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.43 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.54 
 
 		 419 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.32 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.43 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.67 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  48.19 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.1 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.84 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  46.86 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  46.86 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  47.1 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  46.86 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  47.1 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  47.94 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  47.1 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  47.1 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.08 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  47.1 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.38 
 
 		 406 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.56 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.54 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  46.86 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  48.54 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.02 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.02 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.54 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  48.92 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.4 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.48 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.46 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.16 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.76 
 
 		 414 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.92 
 
 		 414 aa  404  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.36 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.65 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.55 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.04 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.46 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  45.04 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.64 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  46.27 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.62 
 
 		 412 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.36 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.34 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.88 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  47.99 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.64 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.16 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.18 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.63 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.54 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>