More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2439 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  98.8 
 
 
417 aa  831    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  83.95 
 
 
419 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
417 aa  839    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  85.61 
 
 
417 aa  724    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
417 aa  839    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  80.24 
 
 
415 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.97 
 
 
421 aa  618  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  70.81 
 
 
426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.19 
 
 
435 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.38 
 
 
425 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  65.33 
 
 
429 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.44 
 
 
433 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.29 
 
 
421 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  63.7 
 
 
424 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.57 
 
 
435 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.23 
 
 
449 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.99 
 
 
443 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  58.26 
 
 
441 aa  488  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  57.41 
 
 
421 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  59.86 
 
 
425 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.6 
 
 
442 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.81 
 
 
432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.37 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  61.5 
 
 
435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.07 
 
 
419 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.57 
 
 
442 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.29 
 
 
441 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  59 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.59 
 
 
418 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.35 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  53.57 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.47 
 
 
411 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.44 
 
 
428 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.48 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.43 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.57 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.92 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.43 
 
 
435 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.68 
 
 
417 aa  388  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  48.11 
 
 
452 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  49.75 
 
 
414 aa  388  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.64 
 
 
412 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.3 
 
 
414 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  48.59 
 
 
424 aa  378  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.97 
 
 
412 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.78 
 
 
408 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.41 
 
 
414 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.26 
 
 
414 aa  368  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.08 
 
 
420 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.18 
 
 
429 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  44.96 
 
 
426 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.93 
 
 
429 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.76 
 
 
415 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.42 
 
 
419 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.42 
 
 
419 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  47.22 
 
 
413 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.04 
 
 
420 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.45 
 
 
413 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  42.76 
 
 
420 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.69 
 
 
429 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  45.23 
 
 
419 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.36 
 
 
414 aa  364  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.39 
 
 
406 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.19 
 
 
415 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  45.32 
 
 
417 aa  362  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  42.79 
 
 
423 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.87 
 
 
451 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  41.47 
 
 
420 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.99 
 
 
420 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.59 
 
 
417 aa  359  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.15 
 
 
416 aa  358  8e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.8 
 
 
409 aa  358  9e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.38 
 
 
414 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  43.27 
 
 
413 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.57 
 
 
410 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.01 
 
 
406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.31 
 
 
412 aa  355  6.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  46.47 
 
 
414 aa  355  6.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  43.38 
 
 
428 aa  355  7.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  46.47 
 
 
414 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.45 
 
 
413 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.45 
 
 
413 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  45.81 
 
 
414 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.17 
 
 
427 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.16 
 
 
414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  38.26 
 
 
417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  44.36 
 
 
416 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.31 
 
 
425 aa  352  8e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  45.52 
 
 
422 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.31 
 
 
415 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.03 
 
 
419 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.91 
 
 
408 aa  352  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.12 
 
 
406 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.65 
 
 
409 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.99 
 
 
406 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  41.15 
 
 
419 aa  351  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.61 
 
 
413 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.51 
 
 
434 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  38.08 
 
 
419 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.45 
 
 
408 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>