More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002694 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  100 
 
 		 403 aa  837    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  89.08 
 
 		 403 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  76.92 
 
 		 404 aa  662    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  65.67 
 
 		 405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  52.74 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  51.6 
 
 		 420 aa  431  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.74 
 
 		 418 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  50.75 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  47.77 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.14 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  50.99 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.12 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  50.25 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  48.64 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  47.62 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  51.24 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.76 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.39 
 
 		 408 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  47.87 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.91 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.6 
 
 		 429 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.38 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  48.91 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.38 
 
 		 425 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  47.39 
 
 		 412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.6 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.73 
 
 		 662 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  45.66 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.38 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.98 
 
 		 605 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  49.38 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.35 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  49.88 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.78 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.12 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.48 
 
 		 657 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  46.72 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  49.63 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  46.73 
 
 		 661 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  49.63 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  49.88 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  49.88 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.77 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  47.52 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  49.88 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.87 
 
 		 406 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  49.88 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  49.88 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  46.65 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  46.48 
 
 		 682 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.43 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  49.88 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  49.63 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.91 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  47.39 
 
 		 420 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  48.09 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  49.38 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  46.23 
 
 		 688 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.52 
 
 		 419 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  43.97 
 
 		 604 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.98 
 
 		 664 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.72 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  47.24 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  43.97 
 
 		 604 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.61 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.29 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.49 
 
 		 406 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.61 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3256  cysteine sulfinate desulfinase  49 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.73 
 
 		 774 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.16 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  45.98 
 
 		 626 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.73 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.41 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.23 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  48.18 
 
 		 569 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.07 
 
 		 674 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.72 
 
 		 673 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.73 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.65 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.4 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.9 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.66 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.28 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 650 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.48 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.4 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.65 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.48 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  45.7 
 
 		 423 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 420 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.45 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 678 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 621 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.07 
 
 		 672 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.02 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.61 
 
 		 416 aa  381  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.33 
 
 		 406 aa  381  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>