More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  100 
 
 		 399 aa  783    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  68.84 
 
 		 399 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  50.25 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  50.5 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  50.5 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  50.5 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  50.38 
 
 		 398 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  50.25 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  49.5 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  51.64 
 
 		 418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  49.87 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  46.75 
 
 		 403 aa  308  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  44.89 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  42.57 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  40.05 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  43.79 
 
 		 414 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  35.77 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  34.48 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  37.47 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  31.87 
 
 		 451 aa  199  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  32.15 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  35.84 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  33.02 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  31.71 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  30.81 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  34.15 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  35.68 
 
 		 410 aa  185  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  34.32 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  31.87 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  37.19 
 
 		 421 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  30.93 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  27.14 
 
 		 412 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  33.89 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  32.07 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  27.52 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  31.27 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  31.42 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  29.79 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  28.88 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.67 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.36 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  30.82 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.64 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.48 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.56 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.76 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.66 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  26.86 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.73 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  24.88 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.32 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.52 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.93 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  27.81 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.65 
 
 		 605 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.02 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  25.42 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  29.6 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  28.26 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.14 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  23.5 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  24.59 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.45 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  23.5 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.54 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  26.95 
 
 		 688 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.28 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.42 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.45 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.95 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.7 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.29 
 
 		 418 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  26.24 
 
 		 423 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.82 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  23.86 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  26.02 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.76 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.85 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.88 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  23.91 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  25.67 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  26.04 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.52 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.99 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  28.21 
 
 		 660 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  23.21 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.53 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  28.21 
 
 		 660 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.52 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  28.21 
 
 		 660 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  28.21 
 
 		 685 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.64 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.64 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.7 
 
 		 650 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.47 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  28.21 
 
 		 660 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.39 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  28.21 
 
 		 660 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  28.21 
 
 		 671 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.59 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>