More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28070 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  100 
 
 		 442 aa  915    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  64.71 
 
 		 411 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  54.93 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0814  aminotransferase, class V  49.54 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  52.07 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  52.07 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  41.45 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  31.87 
 
 		 410 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  33.09 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  32.87 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  32 
 
 		 415 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  33.41 
 
 		 457 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  34.34 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  32.61 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  31.87 
 
 		 451 aa  203  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  32.43 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  32.13 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  32.77 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  29.37 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  29.54 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  28.85 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  31.43 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  32.86 
 
 		 403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  28.12 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.44 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.02 
 
 		 417 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.55 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.24 
 
 		 608 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  30.43 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.79 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  29.18 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  31.23 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  30.71 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  28.89 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  29.05 
 
 		 405 aa  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.45 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.3 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.79 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  28.21 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.23 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.45 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  30.41 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.84 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  26.6 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.63 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.68 
 
 		 414 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  27.06 
 
 		 424 aa  136  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  29.41 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.12 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  29.27 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.12 
 
 		 630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.23 
 
 		 644 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.08 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  27.98 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.59 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  29.5 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  27.34 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.1 
 
 		 410 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.12 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.83 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  27.94 
 
 		 688 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.63 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.27 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.68 
 
 		 666 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.29 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.37 
 
 		 610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.64 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.12 
 
 		 406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  28.03 
 
 		 666 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  28 
 
 		 682 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.84 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.55 
 
 		 650 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  26.89 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.81 
 
 		 407 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.08 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.04 
 
 		 672 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.82 
 
 		 674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.24 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.09 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  26.84 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  26.84 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  26.84 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  26.84 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  26.84 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  26.84 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  29.09 
 
 		 626 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.03 
 
 		 572 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.48 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.84 
 
 		 679 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  26.84 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.43 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  28.05 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.31 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  28.05 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  26.84 
 
 		 406 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>