More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3807 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 399 aa  790    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  65.66 
 
 		 400 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  60.4 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  53.79 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  51.13 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  49.87 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  43.92 
 
 		 410 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  42.79 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  42.28 
 
 		 415 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  46.1 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  36.75 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  40.75 
 
 		 414 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  39.81 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  39.41 
 
 		 409 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  35.11 
 
 		 451 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  44.69 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  39.45 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  38.42 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  43.35 
 
 		 421 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  39.39 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  42.57 
 
 		 399 aa  242  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  40.55 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  35.84 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  40.75 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  32.84 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  39.2 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  36.25 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  36.25 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  36.25 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  35.66 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 425 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  37.96 
 
 		 412 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  35.26 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  35.75 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  35.5 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.59 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.59 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  35.64 
 
 		 418 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.11 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  34.28 
 
 		 417 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.44 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  33.58 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.12 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  30.27 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  30.51 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  30.27 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  30.51 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  30.51 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  30.27 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  30.27 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  30.27 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.1 
 
 		 412 aa  169  8e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  30.55 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  34.97 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.78 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  30.02 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.02 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.49 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.41 
 
 		 435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  32.63 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.07 
 
 		 429 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.59 
 
 		 417 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  30.3 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.49 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.66 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  31.27 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.62 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.51 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  35.29 
 
 		 896 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  30.98 
 
 		 414 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  30.07 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.93 
 
 		 885 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  33.08 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.39 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.39 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.22 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.22 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.62 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.79 
 
 		 674 aa  153  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.01 
 
 		 672 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.99 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  30.43 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.27 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.47 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.88 
 
 		 605 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.93 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  30.77 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.67 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.8 
 
 		 664 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  29.98 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  30.17 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  31.23 
 
 		 406 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.23 
 
 		 406 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.73 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  32.59 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.14 
 
 		 641 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>