More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1449 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
414 aa  854    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  56.97 
 
 
410 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  57.11 
 
 
410 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  55.64 
 
 
415 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  48.65 
 
 
457 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  46.85 
 
 
451 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  51.46 
 
 
418 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  51.21 
 
 
419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  45.25 
 
 
416 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  44.68 
 
 
387 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  44.67 
 
 
411 aa  349  5e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  41.15 
 
 
412 aa  335  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  43.39 
 
 
409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  46.4 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  44.96 
 
 
421 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  42.11 
 
 
403 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  42.22 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  43.8 
 
 
414 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  44.8 
 
 
407 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  40.75 
 
 
399 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  40.86 
 
 
400 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  41.88 
 
 
400 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  39.75 
 
 
407 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  37.84 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.48 
 
 
408 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.22 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  35.24 
 
 
397 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  33.25 
 
 
408 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.97 
 
 
412 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  32.27 
 
 
425 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  32.53 
 
 
412 aa  208  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  32.84 
 
 
420 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.46 
 
 
412 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.09 
 
 
409 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  35.87 
 
 
412 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.64 
 
 
451 aa  203  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  33.41 
 
 
414 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.68 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  32.43 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.57 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.82 
 
 
644 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.57 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  34.65 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.64 
 
 
414 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.19 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  30.62 
 
 
423 aa  200  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.93 
 
 
560 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.72 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.83 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  29.71 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  30.62 
 
 
404 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  30.53 
 
 
419 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.33 
 
 
429 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.85 
 
 
406 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.43 
 
 
408 aa  196  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.31 
 
 
610 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.74 
 
 
419 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.2 
 
 
673 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  34.48 
 
 
399 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.41 
 
 
608 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.67 
 
 
420 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.5 
 
 
419 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.75 
 
 
672 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.01 
 
 
406 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.75 
 
 
674 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  28.71 
 
 
420 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  30.95 
 
 
661 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.98 
 
 
429 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  32.61 
 
 
406 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.31 
 
 
434 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.08 
 
 
420 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.07 
 
 
406 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.48 
 
 
413 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 
406 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.41 
 
 
664 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  29.57 
 
 
406 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  29.57 
 
 
406 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  32.75 
 
 
425 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.81 
 
 
425 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.68 
 
 
678 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.55 
 
 
407 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 
406 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.07 
 
 
407 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.66 
 
 
419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  30.23 
 
 
682 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.07 
 
 
406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.81 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.57 
 
 
444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  30.33 
 
 
420 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.9 
 
 
414 aa  190  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.41 
 
 
572 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  29.51 
 
 
665 aa  189  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.79 
 
 
413 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  29.81 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  29.57 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  29.81 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  29.81 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.1 
 
 
409 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  29.81 
 
 
406 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.71 
 
 
650 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>