More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2890 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  100 
 
 
421 aa  833    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  51.34 
 
 
410 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  51.02 
 
 
415 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  50.61 
 
 
410 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  47.84 
 
 
419 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  45.19 
 
 
457 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  45.78 
 
 
418 aa  359  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  44.97 
 
 
409 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  44.96 
 
 
414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  40.45 
 
 
451 aa  336  3.9999999999999995e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  42.12 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  43.11 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  39.45 
 
 
412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  42.89 
 
 
387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  43.35 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  43.28 
 
 
400 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  39.75 
 
 
400 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  41.16 
 
 
414 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  41.34 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  43.32 
 
 
407 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  40.54 
 
 
403 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  40 
 
 
395 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  40.64 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  39.2 
 
 
398 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  37.19 
 
 
399 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.63 
 
 
429 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.15 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.92 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  31.86 
 
 
425 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.77 
 
 
417 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  35 
 
 
397 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  35.7 
 
 
399 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  30.75 
 
 
412 aa  186  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.06 
 
 
418 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.67 
 
 
412 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.37 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.54 
 
 
406 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  35.99 
 
 
412 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  35.29 
 
 
408 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.75 
 
 
406 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.9 
 
 
406 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.9 
 
 
406 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.77 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.2 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.82 
 
 
414 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.33 
 
 
414 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.07 
 
 
406 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.99 
 
 
408 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  33.42 
 
 
398 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.56 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.02 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.3 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.62 
 
 
414 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.39 
 
 
418 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.07 
 
 
413 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.01 
 
 
414 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.07 
 
 
413 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.07 
 
 
407 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.37 
 
 
406 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.22 
 
 
406 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.94 
 
 
406 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.39 
 
 
428 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.29 
 
 
417 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.99 
 
 
406 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  29.8 
 
 
395 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.62 
 
 
433 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.99 
 
 
406 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.71 
 
 
408 aa  170  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  31.87 
 
 
417 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  32.7 
 
 
406 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  31.65 
 
 
405 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.75 
 
 
406 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.7 
 
 
406 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  30.99 
 
 
406 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.57 
 
 
415 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  30.99 
 
 
406 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.85 
 
 
407 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.99 
 
 
406 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.5 
 
 
664 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.84 
 
 
407 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.22 
 
 
414 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  30.86 
 
 
626 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.31 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  27.01 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.34 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  29.57 
 
 
420 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  30.4 
 
 
420 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  28.74 
 
 
404 aa  166  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.5 
 
 
673 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.75 
 
 
406 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  29.44 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.16 
 
 
572 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  30.6 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  31.11 
 
 
442 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  27.58 
 
 
420 aa  166  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.86 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.64 
 
 
641 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  32.35 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.79 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.78 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>