More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2006 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  100 
 
 		 395 aa  817    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.31 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.55 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.86 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.06 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 414 aa  362  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.33 
 
 		 414 aa  362  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.32 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.75 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.28 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.32 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  47.78 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  45.32 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  45.32 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  45.32 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  45.32 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  45.32 
 
 		 406 aa  358  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  45.32 
 
 		 406 aa  358  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.9 
 
 		 414 aa  358  8e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  45.07 
 
 		 406 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  45.07 
 
 		 406 aa  356  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  45.07 
 
 		 406 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.68 
 
 		 418 aa  355  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.56 
 
 		 412 aa  353  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.99 
 
 		 412 aa  350  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.78 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.19 
 
 		 417 aa  348  8e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  43.7 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  42.22 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.24 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.32 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 412 aa  345  7e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 408 aa  344  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.41 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.26 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.24 
 
 		 425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.15 
 
 		 419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.41 
 
 		 406 aa  338  8e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.07 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  43.38 
 
 		 420 aa  335  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  41.83 
 
 		 424 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.61 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  43 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 451 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  43 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  43.84 
 
 		 414 aa  332  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  42.72 
 
 		 416 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.28 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.61 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.48 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  43.98 
 
 		 419 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.53 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  42.68 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  41.94 
 
 		 421 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.73 
 
 		 406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  41.73 
 
 		 414 aa  329  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.48 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  41.73 
 
 		 414 aa  328  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  43.84 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  42.51 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.69 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.34 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.15 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.88 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  41.38 
 
 		 420 aa  325  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.79 
 
 		 414 aa  325  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.53 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.51 
 
 		 416 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  43 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.49 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.64 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.39 
 
 		 417 aa  322  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.75 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.81 
 
 		 441 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.54 
 
 		 404 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  41.44 
 
 		 429 aa  322  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  42.3 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.57 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.51 
 
 		 418 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.25 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.76 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.79 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  41.01 
 
 		 412 aa  320  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.18 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.96 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.85 
 
 		 417 aa  319  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  41.77 
 
 		 423 aa  319  7e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  40.59 
 
 		 429 aa  318  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.49 
 
 		 413 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 413 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.73 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.35 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  40.1 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.94 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.01 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>