More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12890 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  100 
 
 		 422 aa  870    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  64.06 
 
 		 409 aa  554  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.39 
 
 		 442 aa  521  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.66 
 
 		 429 aa  488  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.37 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  48.63 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.74 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.59 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.34 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.87 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  47.37 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  47.37 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  47.37 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.12 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  47.37 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.26 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  47.37 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  47.37 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  47.37 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  47.12 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  47.22 
 
 		 410 aa  388  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.72 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  47.12 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.48 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.48 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.87 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  47.56 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.87 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.22 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.62 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.5 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  49.62 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.75 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.7 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  45.91 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.57 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.04 
 
 		 443 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.59 
 
 		 421 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.6 
 
 		 414 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.86 
 
 		 412 aa  362  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.95 
 
 		 404 aa  362  9e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  45.61 
 
 		 421 aa  362  9e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.86 
 
 		 412 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 413 aa  360  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 413 aa  360  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.92 
 
 		 420 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.37 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  44.44 
 
 		 420 aa  358  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  43.22 
 
 		 413 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.34 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.86 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  44.66 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.85 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.36 
 
 		 416 aa  356  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.03 
 
 		 419 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.03 
 
 		 419 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.02 
 
 		 420 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.99 
 
 		 428 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.85 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.19 
 
 		 442 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  45.14 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.11 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.92 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  44.11 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.71 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  44.11 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2052  aminotransferase, class V  41.31 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.131609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.9 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  46 
 
 		 451 aa  349  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.11 
 
 		 427 aa  348  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.11 
 
 		 408 aa  348  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.74 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.81 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  43.11 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  42.82 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  45.64 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  42.25 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  44.55 
 
 		 404 aa  345  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  42 
 
 		 405 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.96 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.03 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.03 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.15 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.25 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.5 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.61 
 
 		 641 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.25 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  44.56 
 
 		 604 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.19 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  44.56 
 
 		 604 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.25 
 
 		 406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.5 
 
 		 406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>