More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2052 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2052  aminotransferase, class V  100 
 
 		 400 aa  821    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.131609  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1139  Cysteine desulfurase  53.16 
 
 		 400 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.9 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.37 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.35 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.84 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.12 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  45.98 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  45.98 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  45.73 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  45.98 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  45.73 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  45.73 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  45.73 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.74 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  45.73 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.73 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  45.98 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.36 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  44.44 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.75 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  43.36 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.29 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.79 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.54 
 
 		 419 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.46 
 
 		 417 aa  362  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  41.31 
 
 		 422 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.8 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  42.79 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 412 aa  357  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.61 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  43.11 
 
 		 410 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.54 
 
 		 420 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.65 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  42.25 
 
 		 414 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.11 
 
 		 414 aa  353  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.96 
 
 		 419 aa  353  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.4 
 
 		 425 aa  352  5e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.25 
 
 		 415 aa  352  8.999999999999999e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.35 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  43.78 
 
 		 405 aa  350  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.6 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  43.43 
 
 		 417 aa  348  9e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.07 
 
 		 417 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.91 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.6 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  40.6 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.11 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.6 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  40.6 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  40.7 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.6 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.6 
 
 		 406 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  41.38 
 
 		 423 aa  346  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 414 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.94 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.46 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.35 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.1 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  41.35 
 
 		 410 aa  343  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  42.71 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.8 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.61 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.95 
 
 		 415 aa  342  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43 
 
 		 404 aa  342  7e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.15 
 
 		 406 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  39.85 
 
 		 406 aa  342  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  43.51 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.1 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  39.2 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.1 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.67 
 
 		 427 aa  340  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.85 
 
 		 414 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  39.9 
 
 		 406 aa  338  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.85 
 
 		 412 aa  338  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  41.4 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.17 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.69 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  41.54 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  39.9 
 
 		 406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  39.7 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.44 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  42.08 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  39.45 
 
 		 405 aa  336  5e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.1 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.86 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.41 
 
 		 414 aa  335  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  42.25 
 
 		 456 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  38.19 
 
 		 414 aa  335  9e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  38.19 
 
 		 414 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.69 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.35 
 
 		 412 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  41.29 
 
 		 416 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.2 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  41.29 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>