More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26810 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  100 
 
 
409 aa  848    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.58 
 
 
442 aa  571  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  64.06 
 
 
422 aa  554  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.76 
 
 
429 aa  504  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.02 
 
 
412 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  47.57 
 
 
410 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  49.23 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  49.23 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.28 
 
 
417 aa  398  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  48.88 
 
 
410 aa  395  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  48.98 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.62 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  48.98 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  48.98 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  49.23 
 
 
406 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  49.23 
 
 
406 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  49.23 
 
 
406 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.99 
 
 
409 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.72 
 
 
406 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  48.98 
 
 
406 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.5 
 
 
415 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.87 
 
 
429 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.62 
 
 
429 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.57 
 
 
406 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.98 
 
 
414 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.81 
 
 
406 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.37 
 
 
429 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.25 
 
 
414 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  45 
 
 
414 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.86 
 
 
425 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.5 
 
 
408 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  43.86 
 
 
413 aa  365  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.67 
 
 
413 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.67 
 
 
413 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  44.25 
 
 
404 aa  363  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.86 
 
 
412 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.76 
 
 
410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46 
 
 
429 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  45.14 
 
 
405 aa  360  2e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  43.75 
 
 
425 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  44 
 
 
416 aa  360  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.53 
 
 
417 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.38 
 
 
451 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  44 
 
 
404 aa  358  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.03 
 
 
411 aa  358  9e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.88 
 
 
412 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.6 
 
 
404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.79 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.91 
 
 
418 aa  355  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  44.9 
 
 
424 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.14 
 
 
414 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.29 
 
 
407 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2052  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
400 aa  355  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.131609  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.18 
 
 
399 aa  354  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.11 
 
 
417 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.65 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  43.52 
 
 
421 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.93 
 
 
406 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  44.23 
 
 
404 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.2 
 
 
417 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.61 
 
 
408 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.82 
 
 
433 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.89 
 
 
415 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  43.14 
 
 
405 aa  348  7e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.18 
 
 
406 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  44.21 
 
 
408 aa  348  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.52 
 
 
420 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.7 
 
 
419 aa  348  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.5 
 
 
412 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.18 
 
 
406 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  42.89 
 
 
405 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.18 
 
 
406 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.18 
 
 
406 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.71 
 
 
434 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.75 
 
 
443 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.32 
 
 
407 aa  346  5e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.22 
 
 
427 aa  345  7e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.71 
 
 
406 aa  345  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  44.42 
 
 
419 aa  345  8e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.93 
 
 
406 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.47 
 
 
406 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.75 
 
 
415 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.98 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.93 
 
 
406 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.05 
 
 
420 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.79 
 
 
418 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.91 
 
 
442 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.68 
 
 
406 aa  342  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.56 
 
 
434 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  43.07 
 
 
423 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.68 
 
 
406 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.36 
 
 
414 aa  339  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.61 
 
 
421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.89 
 
 
419 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.11 
 
 
414 aa  338  7e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.75 
 
 
419 aa  338  9e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  42.29 
 
 
420 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  42.93 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  42.64 
 
 
414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  40.05 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>