More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0220 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  79.02 
 
 
410 aa  705    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  100 
 
 
410 aa  851    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  71.11 
 
 
405 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.98 
 
 
406 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.44 
 
 
412 aa  526  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  60.73 
 
 
406 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  60.73 
 
 
406 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  60.49 
 
 
406 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  60.73 
 
 
406 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.73 
 
 
406 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.15 
 
 
406 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  60.49 
 
 
406 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  58.85 
 
 
408 aa  523  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  60.49 
 
 
406 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  60.49 
 
 
406 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  60.49 
 
 
406 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  60.49 
 
 
406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.62 
 
 
406 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  56.27 
 
 
413 aa  481  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.02 
 
 
413 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.02 
 
 
413 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.31 
 
 
410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.1 
 
 
417 aa  458  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.16 
 
 
404 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.93 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
409 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  53.43 
 
 
420 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  53.22 
 
 
408 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.46 
 
 
420 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.6 
 
 
408 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.46 
 
 
419 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  52.35 
 
 
419 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.22 
 
 
419 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
406 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.36 
 
 
417 aa  428  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.77 
 
 
415 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
414 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  50.25 
 
 
420 aa  428  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.75 
 
 
412 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  50.99 
 
 
423 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.51 
 
 
414 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.28 
 
 
412 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.65 
 
 
404 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.14 
 
 
451 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
418 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  48.53 
 
 
414 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  50.12 
 
 
420 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  50 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  50.12 
 
 
419 aa  415  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  48.14 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.25 
 
 
414 aa  414  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
418 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.62 
 
 
420 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.67 
 
 
429 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.02 
 
 
412 aa  408  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.65 
 
 
414 aa  411  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.75 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.54 
 
 
429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.51 
 
 
415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.29 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.48 
 
 
425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  45.97 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.53 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  47.57 
 
 
409 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  46.29 
 
 
405 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  48.91 
 
 
414 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.04 
 
 
444 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.21 
 
 
411 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.93 
 
 
441 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.24 
 
 
774 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  46.88 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.54 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  47.74 
 
 
626 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  49.88 
 
 
417 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.57 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.8 
 
 
415 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.36 
 
 
414 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  48 
 
 
629 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  46.29 
 
 
405 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.1 
 
 
429 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  48.01 
 
 
405 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  47.19 
 
 
414 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  47.19 
 
 
414 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.83 
 
 
414 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.16 
 
 
419 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.23 
 
 
407 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  47.56 
 
 
417 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.42 
 
 
421 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  47.92 
 
 
416 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  44.91 
 
 
414 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  46.68 
 
 
422 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.74 
 
 
657 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.75 
 
 
434 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.34 
 
 
407 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.74 
 
 
678 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.38 
 
 
662 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.27 
 
 
413 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.42 
 
 
413 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  48.53 
 
 
496 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>