More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0343 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 398 aa  805    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  48.85 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  37.84 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  36.87 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  39.39 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  37.69 
 
 		 418 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  37.14 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  36.91 
 
 		 411 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  36.01 
 
 		 419 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  36.32 
 
 		 410 aa  225  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  34.4 
 
 		 451 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  37.11 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  35.43 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  33.03 
 
 		 457 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  34.03 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  34.84 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  34.34 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  38.66 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  39.2 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  37.85 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  35.59 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  37.69 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  35.49 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  36.92 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  29.37 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  32.81 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  36.65 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  36.22 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.18 
 
 		 604 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.18 
 
 		 604 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  35.35 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.97 
 
 		 608 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.13 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.19 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33 
 
 		 435 aa  173  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  30.58 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.58 
 
 		 433 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  33.73 
 
 		 414 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  31.88 
 
 		 682 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  29.57 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32 
 
 		 885 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 605 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.58 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  33.01 
 
 		 661 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  31.64 
 
 		 688 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  33 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  29.83 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.64 
 
 		 666 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.48 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.64 
 
 		 650 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.9 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  33 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.37 
 
 		 630 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.78 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  32.93 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.85 
 
 		 674 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.83 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.49 
 
 		 678 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.4 
 
 		 641 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.85 
 
 		 672 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.58 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.38 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.39 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  32.42 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  32.29 
 
 		 420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.55 
 
 		 621 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  30.3 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  31.16 
 
 		 666 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  31 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.44 
 
 		 413 aa  163  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.25 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.58 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  29.15 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.58 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.33 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.19 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  32.22 
 
 		 665 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.08 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.3 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  33.16 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  33.59 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.5 
 
 		 417 aa  159  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  29.02 
 
 		 405 aa  159  8e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.99 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  31.4 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.13 
 
 		 664 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.64 
 
 		 679 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.71 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  31.33 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.95 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.68 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  31.44 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.85 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.44 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.78 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  31.44 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.99 
 
 		 644 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.16 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>