More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2187 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  100 
 
 
422 aa  835    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.02 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.19 
 
 
415 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 
429 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
429 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.83 
 
 
412 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 
429 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  45.11 
 
 
404 aa  375  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.04 
 
 
429 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.89 
 
 
404 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.26 
 
 
413 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  45.64 
 
 
413 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.99 
 
 
420 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.13 
 
 
418 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.56 
 
 
408 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.13 
 
 
418 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.23 
 
 
414 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.8 
 
 
414 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  43.78 
 
 
414 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  45.19 
 
 
414 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.12 
 
 
425 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  45.19 
 
 
414 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.16 
 
 
413 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.1 
 
 
416 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.46 
 
 
451 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  42.89 
 
 
405 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  42.89 
 
 
405 aa  364  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.77 
 
 
414 aa  362  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  44.84 
 
 
405 aa  361  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.75 
 
 
419 aa  361  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.5 
 
 
774 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  41.42 
 
 
414 aa  360  3e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.48 
 
 
664 aa  359  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.96 
 
 
678 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.03 
 
 
407 aa  359  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.36 
 
 
421 aa  359  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  42.13 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.72 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.38 
 
 
408 aa  358  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.21 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.98 
 
 
641 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.09 
 
 
413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  40.69 
 
 
413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  356  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.29 
 
 
426 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.78 
 
 
413 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.93 
 
 
412 aa  354  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.78 
 
 
413 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.37 
 
 
605 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.47 
 
 
672 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.88 
 
 
427 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.47 
 
 
674 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.61 
 
 
413 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.31 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  45.14 
 
 
416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.22 
 
 
673 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.11 
 
 
413 aa  352  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.7 
 
 
408 aa  353  5e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  43.29 
 
 
404 aa  352  8.999999999999999e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.2 
 
 
413 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.2 
 
 
413 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.34 
 
 
629 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.29 
 
 
407 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.75 
 
 
406 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  45.71 
 
 
661 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.85 
 
 
409 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.43 
 
 
405 aa  348  8e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.39 
 
 
420 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  43.43 
 
 
412 aa  347  2e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  39.5 
 
 
405 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  40.54 
 
 
420 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.03 
 
 
417 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.71 
 
 
406 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.73 
 
 
650 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.25 
 
 
414 aa  346  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  43.36 
 
 
626 aa  345  6e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.83 
 
 
419 aa  345  7e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.93 
 
 
406 aa  345  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.69 
 
 
406 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  45.71 
 
 
604 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  45.71 
 
 
604 aa  345  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.21 
 
 
414 aa  344  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.23 
 
 
666 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.19 
 
 
630 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.79 
 
 
406 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  40.36 
 
 
412 aa  342  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.07 
 
 
644 aa  342  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  45.45 
 
 
666 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.71 
 
 
406 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  43 
 
 
422 aa  342  8e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.53 
 
 
679 aa  342  8e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.27 
 
 
608 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  43.42 
 
 
415 aa  342  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.71 
 
 
406 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.8 
 
 
409 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.48 
 
 
413 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.71 
 
 
406 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.56 
 
 
406 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.71 
 
 
406 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.8 
 
 
662 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>