More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0805 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  100 
 
 		 416 aa  864    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  71.39 
 
 		 411 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  64.46 
 
 		 409 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  66.32 
 
 		 387 aa  545  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  48.14 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  45.72 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  47.38 
 
 		 412 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  47.07 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  45.21 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  45.25 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  44.12 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  42.76 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  43.77 
 
 		 419 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  43.11 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  39.8 
 
 		 395 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  39.45 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  39.85 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  40.74 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  39.51 
 
 		 400 aa  252  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  39.01 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  39.4 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  37.31 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  38.06 
 
 		 407 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  35.29 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  34.84 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  31.92 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 408 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  32.2 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.4 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.09 
 
 		 429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.23 
 
 		 417 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.67 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  29.33 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.59 
 
 		 774 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.13 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  31.01 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  31.08 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  29.48 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.29 
 
 		 608 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.88 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  32.51 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.58 
 
 		 662 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  30.81 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.46 
 
 		 672 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.29 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.46 
 
 		 674 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.21 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.17 
 
 		 641 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.29 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  28.24 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.98 
 
 		 678 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  30.56 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.1 
 
 		 420 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.82 
 
 		 673 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  30.48 
 
 		 661 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.16 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.66 
 
 		 650 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.46 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.09 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.4 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.95 
 
 		 630 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.68 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.68 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.86 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.48 
 
 		 420 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  30.42 
 
 		 682 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.98 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.42 
 
 		 666 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.84 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  28.68 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  29.79 
 
 		 626 aa  176  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.76 
 
 		 664 aa  176  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  28.43 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.92 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  28.68 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.53 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  28.68 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  28.68 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  29.51 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  29.52 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  29.31 
 
 		 671 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.81 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.72 
 
 		 679 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  29.31 
 
 		 660 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  29.31 
 
 		 660 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.62 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  29.31 
 
 		 660 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  29.55 
 
 		 685 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.81 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  29.55 
 
 		 660 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  29.55 
 
 		 660 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  28.43 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  31.5 
 
 		 604 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.43 
 
 		 644 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  28.43 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.43 
 
 		 621 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.21 
 
 		 425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  31.5 
 
 		 604 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  29.95 
 
 		 666 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>